99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23370 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  100 
 
 
241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 
215 aa  158  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  43.83 
 
 
216 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  39.67 
 
 
219 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  42.37 
 
 
211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  38.96 
 
 
212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  37.39 
 
 
218 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  39.21 
 
 
207 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 
216 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  39.23 
 
 
209 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  33.47 
 
 
217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 
217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  37.32 
 
 
209 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  36.74 
 
 
209 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  37.05 
 
 
219 aa  99.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  32.64 
 
 
218 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  36.4 
 
 
211 aa  95.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  33.91 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  34.09 
 
 
213 aa  89.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.33 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  33.78 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  34.43 
 
 
212 aa  86.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  35 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.86 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.72 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  36.05 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  29.52 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1715  metal-dependent hydrolase  36.96 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  40.26 
 
 
353 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  38.33 
 
 
535 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  35.8 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  35.63 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  23.27 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 
229 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
352 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0942  metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 
234 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338724  normal  0.244099 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.51 
 
 
367 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  38.16 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0561  metal-dependent hydrolase  29.19 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.844766  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0596  metal-dependent hydrolase  29.19 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0441  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.03 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  26.6 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 
255 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  29.81 
 
 
225 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1769  metal-dependent hydrolase  35.23 
 
 
234 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3663  metal-dependent hydrolase  27.95 
 
 
235 aa  45.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  32.11 
 
 
227 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  36.94 
 
 
322 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  32.11 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  35.48 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 
542 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  31.69 
 
 
403 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  32.11 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  29.81 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  32.11 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  35.48 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  32.11 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  32.11 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  33.73 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2032  beta-lactamase domain protein  23.9 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.60548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2063  beta-lactamase domain-containing protein  47.46 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2096  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 
535 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.894663  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0721  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.25 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1519  metal-dependent hydrolase  33.7 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.835845 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  25.36 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  35.48 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  38.98 
 
 
538 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  35.14 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  35.21 
 
 
348 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  38 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  31.19 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0023  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  31.19 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  28.3 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2693  beta-lactamase domain protein  47.17 
 
 
256 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.552657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  31.19 
 
 
227 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  46.77 
 
 
353 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 
281 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
243 aa  42  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  36 
 
 
281 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 
281 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  39.71 
 
 
324 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 
570 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  39.71 
 
 
324 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  39.71 
 
 
324 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1144  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 
256 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  30.28 
 
 
228 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.81 
 
 
210 aa  42  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  35.63 
 
 
320 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  39.71 
 
 
324 aa  42  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  37.33 
 
 
667 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  34.21 
 
 
258 aa  41.6  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>