89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0515 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
211 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.32 
 
 
213 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  49.74 
 
 
219 aa  159  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  46.26 
 
 
209 aa  158  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  44.65 
 
 
210 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  45.33 
 
 
212 aa  154  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  40 
 
 
218 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  41.15 
 
 
213 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  41.83 
 
 
215 aa  142  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  42.13 
 
 
209 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.38 
 
 
214 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.94 
 
 
219 aa  132  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  41.87 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  37.67 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  39.32 
 
 
212 aa  122  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  40.47 
 
 
215 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 
217 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  37.68 
 
 
217 aa  117  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 
217 aa  117  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  42.78 
 
 
214 aa  114  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  37.5 
 
 
211 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  42.94 
 
 
190 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
216 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 
207 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  41.49 
 
 
211 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  36.4 
 
 
241 aa  95.1  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  29.35 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  27.62 
 
 
244 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  30.9 
 
 
223 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  29.01 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  28.8 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  30.86 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  29.51 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  28.95 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  31.06 
 
 
255 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
235 aa  51.6  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  24.87 
 
 
225 aa  51.6  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4450  hypothetical protein  27.6 
 
 
270 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.29 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  23.63 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1358  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  26.99 
 
 
251 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  28.32 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 
535 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  38.18 
 
 
243 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  25.1 
 
 
281 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.72 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.33 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0879  hypothetical protein  31.11 
 
 
244 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  27.23 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  28.4 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  27.17 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  29.93 
 
 
292 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  26.15 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  26.53 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1362  metal-dependent hydrolase  26.41 
 
 
234 aa  45.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2724  hypothetical protein  26.03 
 
 
247 aa  45.1  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  24.6 
 
 
227 aa  45.1  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.67 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1310  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  29.07 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0262357  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  29.1 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  24.02 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5192  hypothetical protein  37.88 
 
 
541 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  26.84 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  26.39 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2788  UPF0173 metal-dependent hydrolase  41.07 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  26.92 
 
 
530 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3315  beta-lactamase domain protein  39.66 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  26.92 
 
 
530 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  26.84 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  25.7 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  26.92 
 
 
530 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.09 
 
 
291 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2096  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 
535 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.894663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  24.26 
 
 
226 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1646  hypothetical protein  29.17 
 
 
221 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
239 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  27.71 
 
 
237 aa  42  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
538 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4170  hypothetical protein  29.38 
 
 
253 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
218 aa  42  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>