50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3973 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  48.6 
 
 
213 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  51.64 
 
 
212 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  49.07 
 
 
210 aa  205  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  42.66 
 
 
218 aa  184  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  45.54 
 
 
213 aa  177  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  47.42 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  43.58 
 
 
209 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  44.6 
 
 
209 aa  165  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  37.96 
 
 
209 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  40.76 
 
 
215 aa  145  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.73 
 
 
219 aa  144  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  34.11 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 
211 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  38.03 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  35.43 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  45.77 
 
 
190 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  40 
 
 
217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  38.04 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  38.59 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
216 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 
219 aa  121  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  34.16 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  40 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  30.33 
 
 
241 aa  87.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  28.72 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  30.15 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  26.2 
 
 
258 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  27.59 
 
 
223 aa  47  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  27.6 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  24.74 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  27.47 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  26.04 
 
 
218 aa  45.4  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  27.89 
 
 
281 aa  45.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 
224 aa  45.1  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  36.26 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  28.88 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  29.28 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2782  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 
258 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.492368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2724  hypothetical protein  28.9 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0721  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.56 
 
 
269 aa  42.4  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  45.61 
 
 
230 aa  42  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3315  beta-lactamase domain protein  41.38 
 
 
236 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  41.07 
 
 
230 aa  41.2  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>