275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1819 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  448  1e-125  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  79.37 
 
 
223 aa  371  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  72.65 
 
 
223 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  74.89 
 
 
221 aa  345  5e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  44.39 
 
 
211 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  42.52 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  39.64 
 
 
218 aa  169  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  42.2 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  39.29 
 
 
220 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  34.78 
 
 
228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  32.99 
 
 
244 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1310  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  33.63 
 
 
195 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0262357  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1358  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  32.09 
 
 
251 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  32.74 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0204  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  39.39 
 
 
190 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000768603  normal  0.146366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  30.94 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1646  hypothetical protein  30.14 
 
 
221 aa  95.9  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  28.96 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2288  hypothetical protein  30.86 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.18 
 
 
291 aa  93.2  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0400  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  39.85 
 
 
190 aa  92.4  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.564256 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09183  putative metal-dependent hydrolase  27.75 
 
 
270 aa  88.6  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607675  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  30.43 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0529  hypothetical protein  31.08 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2596  beta-lactamase domain protein  24.46 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477747  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  28.96 
 
 
281 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.79 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  28.77 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.64 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  31.63 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  30.22 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  28.81 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  26.54 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  28.25 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  28.83 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6076  putative metal-dependent hydrolase  28.11 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.9 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2759  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0721774  normal  0.565273 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2724  hypothetical protein  27.02 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.23 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  28.18 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  28.72 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 
285 aa  75.1  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5695  metal-dependent hydrolase  30 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.23 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  27.91 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0583  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  31.28 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  28.51 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0606  hypothetical protein  25.56 
 
 
248 aa  72  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.431786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  26.43 
 
 
230 aa  72  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  28.76 
 
 
226 aa  72  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  30.22 
 
 
211 aa  72  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0489  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.22 
 
 
248 aa  71.6  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  26.26 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4450  hypothetical protein  27.95 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  29.71 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.02 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  24.09 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  24.62 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  26.91 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1816  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2407  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000667891  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  23.28 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2127  metallo-beta-lactamase family protein  26.7 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4313  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.91 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.678939  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  28.09 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  25.21 
 
 
296 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  27.88 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  28 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.1 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2724  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  25.45 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  26.42 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3382  hypothetical protein  27.97 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.614782 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0879  hypothetical protein  26.41 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3945  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24739  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  23 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2750  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.435711  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  27.11 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3617  beta-lactamase domain-containing protein  24.37 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.67 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  24.06 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  25 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  23.58 
 
 
227 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>