40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10801 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  431  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  79.17 
 
 
216 aa  339  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  76.04 
 
 
218 aa  333  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  74.65 
 
 
217 aa  328  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  73.73 
 
 
217 aa  323  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  73.73 
 
 
217 aa  323  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  59.45 
 
 
219 aa  261  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  57.75 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  54.05 
 
 
207 aa  184  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  46.08 
 
 
211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  44.65 
 
 
216 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  46.23 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 
209 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 
209 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  37.98 
 
 
209 aa  134  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  38.69 
 
 
213 aa  132  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.7 
 
 
213 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  41.85 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  38.96 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  38.89 
 
 
212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  38.92 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.59 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  34.43 
 
 
218 aa  124  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  38.25 
 
 
215 aa  124  9e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  39.32 
 
 
211 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38 
 
 
219 aa  118  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  34.26 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  36.36 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  37.58 
 
 
190 aa  101  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  25.94 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0119  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  32 
 
 
355 aa  45.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
667 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1998  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  28.38 
 
 
357 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  22.41 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0288  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  29.33 
 
 
355 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.440104  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 
555 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  40.32 
 
 
236 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 
243 aa  41.6  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  37.33 
 
 
813 aa  42  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>