100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6881 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
207 aa  398  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  49.29 
 
 
211 aa  215  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  48.4 
 
 
219 aa  191  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  54.05 
 
 
212 aa  184  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  53.44 
 
 
218 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  53.72 
 
 
216 aa  175  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  46.51 
 
 
215 aa  174  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  49.74 
 
 
217 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  49.74 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  49.74 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  42.38 
 
 
209 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  45.65 
 
 
216 aa  151  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  47.25 
 
 
209 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.03 
 
 
214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  42.13 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  42.25 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  39.21 
 
 
241 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  35.78 
 
 
218 aa  121  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  40.86 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.44 
 
 
219 aa  119  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.91 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  41.31 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  38.92 
 
 
213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  37.89 
 
 
211 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  37.38 
 
 
212 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 
210 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  35.14 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  35.21 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  28.57 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  28.18 
 
 
223 aa  58.2  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  29.32 
 
 
223 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  29.67 
 
 
252 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  25.45 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  30.64 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  27.53 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  24.86 
 
 
255 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  25.94 
 
 
226 aa  48.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  26.48 
 
 
281 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.95 
 
 
291 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2724  hypothetical protein  29.09 
 
 
247 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  25.53 
 
 
226 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  28.44 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  25.73 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  22.94 
 
 
222 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1476  beta-lactamase domain protein  41.07 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  35.79 
 
 
667 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 
447 aa  45.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1310  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  27.47 
 
 
195 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0262357  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  31.07 
 
 
255 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  27.27 
 
 
211 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  29.45 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  30.53 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2368  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 
227 aa  45.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355207  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1778  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.32 
 
 
243 aa  45.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0392485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  30.43 
 
 
281 aa  45.1  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
224 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 
227 aa  45.1  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
476 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1362  metal-dependent hydrolase  38.36 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0567  hypothetical protein  38.27 
 
 
284 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0190057  hitchhiker  0.00000419669 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 
352 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 
353 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.49 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  29.89 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  34.16 
 
 
258 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1763  metal-dependent hydrolase  24.17 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1797  metal-dependent hydrolase  24.17 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  25.68 
 
 
403 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1270  metal-dependent hydrolase  23.83 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 
530 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  31.17 
 
 
330 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  27.11 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 
530 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  29.17 
 
 
530 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2407  beta-lactamase domain protein  27 
 
 
233 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000667891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0944  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.65 
 
 
277 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2096  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
535 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.894663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  31.08 
 
 
320 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  36.89 
 
 
261 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  31.03 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 
535 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  32.94 
 
 
365 aa  42  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2596  beta-lactamase domain protein  22.58 
 
 
236 aa  42  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477747  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  26.34 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  23.24 
 
 
209 aa  42  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  26.99 
 
 
225 aa  42  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2177  hypothetical protein  20.45 
 
 
303 aa  42  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1324  putative L-ascorbate-6-phosphate lactonase UlaG  27.35 
 
 
353 aa  41.6  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.56 
 
 
469 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 
538 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  27.21 
 
 
237 aa  41.2  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  37.19 
 
 
265 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  22.75 
 
 
225 aa  41.2  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>