More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6275 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  41.63 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1808  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  40.41 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.72827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.43 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4450  hypothetical protein  36.7 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0944  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.97 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  30.15 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2596  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477747  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4313  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.96 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.678939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  31.64 
 
 		 342 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  31.64 
 
 		 342 aa  96.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  31.64 
 
 		 329 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  27 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  26.47 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 324 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  26.97 
 
 		 423 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  26.05 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  26.05 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  26.05 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  26.89 
 
 		 324 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  26.05 
 
 		 324 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  26.89 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  25.63 
 
 		 324 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  28.83 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  27.34 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  26.95 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2368  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.33 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  25.76 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  28.93 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  28.03 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  29.23 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  28.96 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.76 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  26.25 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  26.22 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3589  beta-lactamase domain protein  22.57 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  27.11 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  27.11 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  27.11 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  27.88 
 
 		 360 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  27.27 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1805  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.73 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  27.57 
 
 		 218 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0288  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  22.55 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.440104  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1154  hypothetical protein  27.98 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  26.22 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  26.11 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  28.88 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2125  metal-dependent hydrolase  27.24 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192097  normal  0.207518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  27.24 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  26.59 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  26.42 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  26.92 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  26.47 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  28.03 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  23.64 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0119  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  22.63 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  25.44 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.74 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  26.36 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  29.41 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  25.11 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  26.39 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  29.58 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4386  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.93 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0244983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  25.46 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0981  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  23.27 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  26.05 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  29.29 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0643  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  22.1 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  26.24 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  23.51 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2540  hypothetical protein  22.91 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.641788  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2496  hypothetical protein  24.73 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  24.19 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0141  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  23.25 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000169271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0133  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  23.25 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  26.01 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  28.41 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  25.95 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  25.2 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.51 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  24.32 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  25.57 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>