261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1271 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  64.68 
 
 
218 aa  292  3e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  47 
 
 
208 aa  175  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  42.58 
 
 
211 aa  171  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  42.33 
 
 
214 aa  167  9e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  39.29 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  38.46 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  38.79 
 
 
223 aa  156  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  36.24 
 
 
221 aa  149  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  37.37 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  40 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  36.36 
 
 
255 aa  121  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  36.65 
 
 
258 aa  119  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1358  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  36.2 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2724  hypothetical protein  33.05 
 
 
247 aa  109  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2288  hypothetical protein  33.48 
 
 
237 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  37.11 
 
 
227 aa  103  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  32.17 
 
 
237 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0583  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 
225 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  32.29 
 
 
227 aa  102  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  35.71 
 
 
230 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  35.75 
 
 
225 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 
222 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  31.73 
 
 
281 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0489  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.67 
 
 
248 aa  97.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09183  putative metal-dependent hydrolase  31.02 
 
 
270 aa  97.1  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607675  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  31.51 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 
239 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  32.22 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0529  hypothetical protein  31.28 
 
 
235 aa  95.9  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0204  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  50 
 
 
190 aa  96.3  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000768603  normal  0.146366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
274 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  30.99 
 
 
225 aa  95.1  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  33.94 
 
 
226 aa  94.7  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  33.18 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
274 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0606  hypothetical protein  28.96 
 
 
248 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.431786 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  33.49 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  32.09 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  30.81 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1646  hypothetical protein  32.7 
 
 
221 aa  92  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  31.28 
 
 
274 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2127  metallo-beta-lactamase family protein  29.26 
 
 
246 aa  92  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 
285 aa  92  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 
224 aa  91.7  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6076  putative metal-dependent hydrolase  32.14 
 
 
252 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1154  hypothetical protein  35.58 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1310  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  37.18 
 
 
195 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0262357  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0400  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  50.52 
 
 
190 aa  90.1  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.564256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  32.11 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  33.18 
 
 
226 aa  88.6  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  31.48 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 
229 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0962  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  30.26 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  30.59 
 
 
226 aa  84.7  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  31.48 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.49 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  31.31 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3617  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  28.57 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3945  beta-lactamase domain-containing protein  28.45 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24739  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  31.74 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  28.07 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  31.12 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.73 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2125  metal-dependent hydrolase  29.67 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192097  normal  0.207518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2407  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000667891  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.35 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.82 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
266 aa  79  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2368  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.8 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  28.49 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.35 
 
 
208 aa  79  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  29.02 
 
 
228 aa  79  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.41 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1808  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  28.99 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.72827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  30.43 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5695  metal-dependent hydrolase  31.6 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3467  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.407477  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  30.37 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1763  metal-dependent hydrolase  27.85 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1797  metal-dependent hydrolase  27.85 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  30.43 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.37 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  28.38 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  30.43 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3294  metal-dependent hydrolase  29.81 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.692615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>