241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2467 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  593  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1808  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  44.76 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.72827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  41.63 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4450  hypothetical protein  39.91 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  34.5 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.3 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0944  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.78 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2596  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477747  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4313  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.04 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.678939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3589  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  24.54 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  24.8 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  24.16 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1220  hypothetical protein  30.53 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000702684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1805  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.35 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  27.98 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.91 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  23.77 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  23.77 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  23.77 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  23.77 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  24.91 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  25.74 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  25.74 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  30.88 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  26.1 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  25.55 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  29.26 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4432  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.66 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0167482  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  24.02 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  23.9 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2125  metal-dependent hydrolase  28.72 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192097  normal  0.207518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.63 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  25.1 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  25.91 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  25.48 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  22.22 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  26.41 
 
 		 371 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  23.9 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  24.14 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0783  hypothetical protein  25.52 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  23.55 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  28.06 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1324  putative L-ascorbate-6-phosphate lactonase UlaG  21.8 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  28.06 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  28.06 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0119  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  22.85 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1021  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.57 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  27.06 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  35.51 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2540  hypothetical protein  28.8 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.641788  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4386  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.57 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0244983  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  27.16 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  24.32 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2368  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0288  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  23.97 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.440104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0962  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  36.03 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  26.14 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  29.06 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.97 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  24.89 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  24.42 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  28.9 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  23.4 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.27 
 
 		 385 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0643  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  23.55 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  24.03 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.57 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  21.18 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  30.53 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  27.84 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  26.39 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  23.86 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  28.04 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  29.03 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  27.5 
 
 		 403 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1816  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  26.77 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  25.98 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  29.08 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1998  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  23.21 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  21.96 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.38 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  25 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>