155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16670 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  100 
 
 
228 aa  461  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  42.36 
 
 
208 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  43.37 
 
 
214 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  37.19 
 
 
211 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  38.55 
 
 
218 aa  122  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  34.78 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  40 
 
 
220 aa  118  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  35.5 
 
 
223 aa  118  7e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  32.5 
 
 
223 aa  116  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  34.97 
 
 
221 aa  111  9e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1646  hypothetical protein  34.25 
 
 
221 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2288  hypothetical protein  32.24 
 
 
237 aa  88.2  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0529  hypothetical protein  35.35 
 
 
235 aa  88.2  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  30.1 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  28.44 
 
 
225 aa  79  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  31.98 
 
 
258 aa  78.2  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  28.97 
 
 
255 aa  78.2  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  29.47 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  28.12 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1816  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 
265 aa  75.1  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0489  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.28 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1358  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  28.21 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  26.92 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09183  putative metal-dependent hydrolase  27.84 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607675  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0606  hypothetical protein  28.9 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.431786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  28.9 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.1 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2724  hypothetical protein  30.69 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  26.84 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.27 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  27.75 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  26.36 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1310  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  31.76 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0262357  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  27.7 
 
 
211 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  31.71 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  26.89 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0400  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  37 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.564256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6076  putative metal-dependent hydrolase  26.8 
 
 
252 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  24.38 
 
 
212 aa  62.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0204  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  34.95 
 
 
190 aa  62.4  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000768603  normal  0.146366 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2127  metallo-beta-lactamase family protein  30.23 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  27.23 
 
 
226 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
222 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  24.89 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  25.23 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2407  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000667891  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  27.14 
 
 
213 aa  59.3  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0879  hypothetical protein  27.73 
 
 
244 aa  59.3  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  28.35 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  26.42 
 
 
227 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  31.45 
 
 
237 aa  58.5  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1763  metal-dependent hydrolase  27.35 
 
 
229 aa  58.5  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1797  metal-dependent hydrolase  27.35 
 
 
229 aa  58.5  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  25.94 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  25.94 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  23.18 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  30.37 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  25.74 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  28.19 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2962  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.97 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00091403  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1270  metal-dependent hydrolase  25.45 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  25.94 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  25.94 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1154  hypothetical protein  27.03 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  26.57 
 
 
252 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  25.94 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  25.94 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  25.94 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  26.18 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  24.3 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  30.19 
 
 
273 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.98 
 
 
211 aa  55.8  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  25.47 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  25.98 
 
 
292 aa  55.5  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 
239 aa  55.5  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  26.67 
 
 
274 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 
285 aa  55.1  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.63 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3116  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.79 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431062  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 
274 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 
211 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  24.68 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  25 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  25.11 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  21.69 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  24.58 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0622  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.6 
 
 
202 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3294  metal-dependent hydrolase  23.11 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.692615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>