150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2962 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2962  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  100 
 
 
220 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00091403  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3116  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  88.99 
 
 
220 aa  400  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431062  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  72.73 
 
 
223 aa  323  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4183  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  52.7 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  48.84 
 
 
215 aa  217  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1402  hypothetical protein  45.81 
 
 
210 aa  211  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1211  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  45.32 
 
 
210 aa  209  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000127632  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1184  hypothetical protein  45.81 
 
 
210 aa  208  5e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  45.9 
 
 
214 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  47.06 
 
 
211 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.52 
 
 
208 aa  156  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  47.9 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.06 
 
 
208 aa  151  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.09 
 
 
211 aa  150  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  43.01 
 
 
211 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  42.59 
 
 
213 aa  149  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.07 
 
 
210 aa  148  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  39.23 
 
 
212 aa  148  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  41.34 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2755  putative zinc-dependent hydrolase  33.18 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2441  zinc-dependent hydrolase, putative  32.87 
 
 
217 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  34.43 
 
 
223 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  36.11 
 
 
212 aa  121  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  29.82 
 
 
243 aa  112  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4491  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.09 
 
 
254 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3370  hypothetical protein  31.78 
 
 
263 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2710  hypothetical protein  31.05 
 
 
290 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2730  hypothetical protein  29.65 
 
 
262 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3372  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.65 
 
 
262 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.323472  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0399  hypothetical protein  30.04 
 
 
250 aa  95.1  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2779  twin-arginine translocation pathway signal  33.51 
 
 
255 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0622  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.65 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4992  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0213  conserved hypothetical protein  34.92 
 
 
211 aa  88.6  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132572  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02141  Zn-dependent hydrolase  27.75 
 
 
242 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2052  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.34 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0437547  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02051  Zn-dependent hydrolase  27.23 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0314417  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27441  Zn-dependent hydrolase  33.53 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2448  hypothetical protein  31.61 
 
 
240 aa  79  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02031  Zn-dependent hydrolase  26.7 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.041064  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  33 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0187  hypothetical protein  26.18 
 
 
241 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0306634  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2129  hypothetical protein  30.36 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3212  hypothetical protein  28.44 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02031  Zn-dependent hydrolase  29.32 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141712  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0101  hypothetical protein  26.09 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  28.35 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  26.46 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  28.71 
 
 
219 aa  62.8  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2642  hypothetical protein  29.59 
 
 
277 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.771371  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  25.63 
 
 
228 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  25.91 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3633  hypothetical protein  28.9 
 
 
290 aa  61.6  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.719397  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1834  hypothetical protein  36.21 
 
 
268 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150106  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0483  hypothetical protein  36.21 
 
 
268 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.711637  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  29.74 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3507  hypothetical protein  26.64 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3193  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1310  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  29.73 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0262357  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3012  putative Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold family  26.34 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  0.288675 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  26.55 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0080  hypothetical protein  24.43 
 
 
271 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0623  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.41 
 
 
271 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  25.13 
 
 
228 aa  59.3  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 
230 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  28.97 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2077  hypothetical protein  27.01 
 
 
279 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  23.98 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  26 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  24.49 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  22.96 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  28.71 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  24.49 
 
 
227 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  23.98 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  23.98 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  23.98 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  23.98 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  23.98 
 
 
227 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  22.22 
 
 
222 aa  55.1  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  23.28 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  23.28 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  28.5 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  26.6 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  25.95 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1154  hypothetical protein  25.49 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  26.49 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7160  hypothetical protein  25.25 
 
 
272 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3617  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  26.26 
 
 
230 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  23.08 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  26.87 
 
 
225 aa  51.6  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  25.63 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  23.32 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  22.96 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3294  metal-dependent hydrolase  22.96 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.692615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>