127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1358 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1358  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  100 
 
 
251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6076  putative metal-dependent hydrolase  59.74 
 
 
252 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09183  putative metal-dependent hydrolase  47.73 
 
 
270 aa  221  8e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  46.12 
 
 
258 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  42.31 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  37.1 
 
 
244 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  31.84 
 
 
218 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  35.1 
 
 
223 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  36.2 
 
 
220 aa  102  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  32.09 
 
 
223 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  31.63 
 
 
223 aa  98.6  9e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  34.26 
 
 
221 aa  98.2  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  30.7 
 
 
214 aa  88.6  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  31.92 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  33.81 
 
 
211 aa  85.9  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1816  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  28.21 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0606  hypothetical protein  25.81 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.431786 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0529  hypothetical protein  26.05 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  28.3 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2724  hypothetical protein  27.19 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  29.06 
 
 
227 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  26.29 
 
 
226 aa  63.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2288  hypothetical protein  26.34 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  28.38 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  27.96 
 
 
226 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  28.12 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1310  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  26.26 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0262357  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2596  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 
236 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477747  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.73 
 
 
291 aa  58.9  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0489  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.11 
 
 
248 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  25.51 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1646  hypothetical protein  26.26 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2127  metallo-beta-lactamase family protein  26.2 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1567  hypothetical protein  30.19 
 
 
167 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  29.5 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  26.15 
 
 
226 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  24.11 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 
274 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 
274 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  25.74 
 
 
274 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  26.4 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  25.25 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  27.27 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  25.39 
 
 
223 aa  53.9  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  24.87 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  25.7 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  25.64 
 
 
226 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.44 
 
 
590 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  24.08 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 
222 aa  52.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0583  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 
225 aa  52  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  26.48 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.8 
 
 
228 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0204  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  32.22 
 
 
190 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000768603  normal  0.146366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  22.34 
 
 
224 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  24.19 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  25.12 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1763  metal-dependent hydrolase  25.89 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1797  metal-dependent hydrolase  25.89 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  26.4 
 
 
227 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  26.4 
 
 
227 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  23.96 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0879  hypothetical protein  23.28 
 
 
244 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2788  UPF0173 metal-dependent hydrolase  24.26 
 
 
230 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  26.32 
 
 
252 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  24.66 
 
 
230 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  27.69 
 
 
237 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.91 
 
 
208 aa  48.9  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  25.82 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  25.82 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  25.82 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  24.55 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  25.89 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  26.74 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  25.82 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0400  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  31.52 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.564256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  23.2 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  25.82 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1021  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.64 
 
 
312 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  27.14 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  25.35 
 
 
227 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  22.81 
 
 
237 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  24.88 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4450  hypothetical protein  25.27 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5695  metal-dependent hydrolase  27.54 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  24.88 
 
 
225 aa  46.2  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0962  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 
230 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4620  hypothetical protein  26.94 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411707  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>