More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0341 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  100 
 
 		 291 aa  545  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  45.49 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4170  hypothetical protein  44.79 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3382  hypothetical protein  44.94 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.614782 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  44.87 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  37.73 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  32.82 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  37.79 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.58 
 
 		 590 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  34.56 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  29.48 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  29.48 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  28.14 
 
 		 324 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  28.14 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  33.64 
 
 		 388 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  33.18 
 
 		 223 aa  93.2  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  31.23 
 
 		 403 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  28.7 
 
 		 423 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  28.19 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.48 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  27.27 
 
 		 324 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  27.27 
 
 		 324 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  27.27 
 
 		 324 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  26.84 
 
 		 324 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3291  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  27.27 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  27.35 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  28.04 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1825  outer membrane protein  25 
 
 		 362 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  29.92 
 
 		 226 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  29.92 
 
 		 226 aa  87  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  33.73 
 
 		 237 aa  86.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  26.56 
 
 		 351 aa  86.3  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 324 aa  85.9  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  28.38 
 
 		 351 aa  85.5  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.57 
 
 		 325 aa  85.5  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  32.03 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  32.03 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  32.03 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  35.62 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.17 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  31.75 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  31.11 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  32.44 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  22.27 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  24.26 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0783  hypothetical protein  26.54 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  31.25 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  32.88 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.02 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  28.64 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.17 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1021  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.62 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  28.63 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  29.49 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  28.14 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  29.53 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  31.31 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  31.06 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.36 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  30.32 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  27.38 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  25.89 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  30.54 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  31.46 
 
 		 226 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  30.96 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  32.27 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.69 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0583  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  31.97 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.36 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  31.92 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  30.59 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  31.55 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  31.82 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  30.73 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  28.85 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.16 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  31.58 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  31.07 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  22.47 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  31.75 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.9 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  30.91 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  31.1 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.91 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3294  metal-dependent hydrolase  30.52 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.692615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  31.07 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  29.84 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  31.36 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  25.51 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  30.91 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>