More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4170 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4170  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  494  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  46.61 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  44.79 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  39.62 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3382  hypothetical protein  38.46 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.614782 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  33.02 
 
 		 308 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.39 
 
 		 590 aa  95.9  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 		 324 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  34.26 
 
 		 388 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  29.11 
 
 		 324 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  29.11 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.05 
 
 		 335 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  28.64 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  29.11 
 
 		 423 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  29.11 
 
 		 324 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  29.11 
 
 		 324 aa  93.2  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  29.11 
 
 		 324 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  33.18 
 
 		 335 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  28.64 
 
 		 324 aa  92.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  34.11 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  27.23 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  27.49 
 
 		 324 aa  89  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  32.09 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1825  outer membrane protein  26.76 
 
 		 362 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  30.65 
 
 		 361 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 		 332 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3291  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  32.42 
 
 		 362 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  29.68 
 
 		 329 aa  85.9  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  30 
 
 		 296 aa  85.9  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.15 
 
 		 354 aa  85.9  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  29.68 
 
 		 342 aa  85.5  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  29.68 
 
 		 342 aa  85.5  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 367 aa  85.1  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  27.63 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  32.26 
 
 		 358 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  34.8 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.23 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  30.54 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  26.67 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  24.42 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  28.91 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  28.91 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  27.24 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  29.96 
 
 		 372 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  31.13 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1021  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.02 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  23.96 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  27.67 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  29.01 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  29.3 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  28.03 
 
 		 372 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.91 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  23.66 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.2 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.2 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  27.57 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  27.83 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  26.76 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  23.08 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  31.03 
 
 		 362 aa  72  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  27.98 
 
 		 351 aa  72  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 		 367 aa  72  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.91 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  27.82 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  27.36 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  34.4 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  30.23 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  25.69 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  29.59 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  28.17 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.3 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.32 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  28.76 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  26.67 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  30.26 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  26.94 
 
 		 392 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  28.11 
 
 		 361 aa  68.6  0.00000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  27.38 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  26.89 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  28.32 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  27.75 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  28.32 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  27.14 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  25.47 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  28.76 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  26.03 
 
 		 353 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  27.63 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  27.7 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  28.21 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  22.52 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  28.74 
 
 		 353 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  22.39 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  28.18 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>