183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3382 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3382  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  528  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.614782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  44.94 
 
 		 291 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  43.35 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  39 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4170  hypothetical protein  38.46 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 		 324 aa  85.9  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  27.8 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  28.95 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  27.57 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  26.97 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  26.67 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1825  outer membrane protein  22.73 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  30.34 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  26.14 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  26.14 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  26.75 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  26.14 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  29.58 
 
 		 360 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  27.73 
 
 		 223 aa  72  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  26.06 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  31.2 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  26.97 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  26.56 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.49 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  29.45 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.99 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.83 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  28.16 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  28.57 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  32.07 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  30 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  27.97 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  26.1 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  27.24 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  28.47 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  28.47 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  27.84 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.34 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  27.96 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3291  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 		 409 aa  62  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  29.54 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  25.21 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  25.21 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  27.57 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  27.5 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.97 
 
 		 590 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  27.34 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  30.94 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  26.32 
 
 		 414 aa  59.3  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  27.43 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  27.21 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38719  predicted protein  24.72 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  30.28 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  23.83 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01370  conserved hypothetical protein  23.45 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  24.18 
 
 		 227 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  23.27 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  23.77 
 
 		 351 aa  55.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  29.1 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  21.48 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.1 
 
 		 419 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  27.44 
 
 		 358 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.08 
 
 		 353 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 227 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2125  metal-dependent hydrolase  23.4 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192097  normal  0.207518 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  24.35 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876476 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  25.53 
 
 		 227 aa  53.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.03 
 
 		 380 aa  52.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  26.12 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1021  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.94 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  26.94 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  23.2 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.88 
 
 		 367 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  29.34 
 
 		 362 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2127  metallo-beta-lactamase family protein  26.09 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  22.31 
 
 		 348 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  23.93 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3945  beta-lactamase domain-containing protein  23.63 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5695  metal-dependent hydrolase  24.07 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  24.09 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  27.62 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  35.51 
 
 		 334 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  28.51 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06900  hypothetical protein  30.94 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25.72 
 
 		 368 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 		 225 aa  49.7  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  28.16 
 
 		 331 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  24.89 
 
 		 354 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  26.67 
 
 		 273 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  37.68 
 
 		 336 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  23.51 
 
 		 320 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>