242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5695 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5695  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
291 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  59.62 
 
 
273 aa  301  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  58.5 
 
 
285 aa  295  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  42.68 
 
 
237 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  40.96 
 
 
242 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3945  beta-lactamase domain-containing protein  40.16 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24739  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  42.35 
 
 
274 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3617  beta-lactamase domain-containing protein  40.56 
 
 
244 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  42.75 
 
 
274 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  41.57 
 
 
274 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  40.89 
 
 
233 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  43.16 
 
 
266 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  37.8 
 
 
230 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  40.49 
 
 
227 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  41.7 
 
 
227 aa  143  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4333  beta-lactamase domain-containing protein  35.77 
 
 
241 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1270  metal-dependent hydrolase  37.25 
 
 
229 aa  142  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3467  beta-lactamase domain protein  36.18 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.407477  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0741  beta-lactamase domain protein  39.74 
 
 
232 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3315  beta-lactamase domain protein  36 
 
 
236 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1797  metal-dependent hydrolase  36.03 
 
 
229 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1763  metal-dependent hydrolase  36.03 
 
 
229 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  38.4 
 
 
237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  34.94 
 
 
239 aa  135  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  35.39 
 
 
225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3663  metal-dependent hydrolase  36.69 
 
 
235 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  36.21 
 
 
239 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1769  metal-dependent hydrolase  34.78 
 
 
234 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1362  metal-dependent hydrolase  35.92 
 
 
234 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  35.1 
 
 
237 aa  132  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  35.2 
 
 
228 aa  132  9e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  36.63 
 
 
225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  35.68 
 
 
240 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  37.25 
 
 
228 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0942  metal-dependent hydrolase  35.12 
 
 
234 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338724  normal  0.244099 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0561  metal-dependent hydrolase  35.08 
 
 
237 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.844766  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0596  metal-dependent hydrolase  35.48 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  37.4 
 
 
226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  36.16 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3294  metal-dependent hydrolase  38.43 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.692615  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  37.33 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  34.16 
 
 
225 aa  125  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  37.55 
 
 
227 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1715  metal-dependent hydrolase  34.41 
 
 
234 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  36.68 
 
 
227 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1519  metal-dependent hydrolase  35.37 
 
 
234 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.835845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 
236 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  37.12 
 
 
227 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  36.24 
 
 
227 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  36.84 
 
 
228 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2229  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
230 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0154515  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  33.06 
 
 
219 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  36.24 
 
 
227 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  36.24 
 
 
227 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  36.24 
 
 
227 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  36.24 
 
 
227 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2125  metal-dependent hydrolase  34.8 
 
 
226 aa  122  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192097  normal  0.207518 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  37.12 
 
 
226 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 
224 aa  122  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  33.73 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  35.81 
 
 
227 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  35.63 
 
 
226 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 
243 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  34.82 
 
 
226 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0962  beta-lactamase domain protein  35.68 
 
 
230 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2268  metallo beta lactamase superfamily protein  35.22 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0942  beta-lactamase domain-containing protein  35.22 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0652855  normal  0.381593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 
224 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2127  metallo-beta-lactamase family protein  33.62 
 
 
246 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2368  beta-lactamase domain protein  35.86 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355207  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2407  beta-lactamase domain protein  34.89 
 
 
233 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000667891  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  36.04 
 
 
225 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  31.97 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0583  beta-lactamase domain protein  35.56 
 
 
225 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  33.07 
 
 
230 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  35.4 
 
 
224 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2788  UPF0173 metal-dependent hydrolase  34.1 
 
 
230 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  32.52 
 
 
223 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 
222 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 
227 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  34.35 
 
 
225 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  34.82 
 
 
235 aa  106  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
225 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  31.78 
 
 
230 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 
227 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1154  hypothetical protein  35.24 
 
 
219 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
222 aa  99.8  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 
218 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 
225 aa  95.9  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2724  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 
240 aa  95.5  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1287  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.02 
 
 
230 aa  93.2  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.66334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0878  hypothetical protein  29.92 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2759  beta-lactamase domain protein  31.64 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0721774  normal  0.565273 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1388  beta-lactamase domain protein  46.15 
 
 
109 aa  89  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0491  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 
227 aa  86.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  33.05 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2750  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.435711  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  29.92 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1347  beta-lactamase domain protein  30.68 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0129245  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>