42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1567 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1567  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  347  6e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1310  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  38.24 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0262357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0204  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  38.33 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000768603  normal  0.146366 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0400  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  35 
 
 		 190 aa  98.6  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.564256 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  32.31 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09183  putative metal-dependent hydrolase  30.3 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607675  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1612  hypothetical protein  32.61 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  43.94 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1358  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  30.19 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  31.54 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6076  putative metal-dependent hydrolase  38.67 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  30.43 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  39.51 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  25 
 
 		 258 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 274 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  29.37 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 274 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  34.67 
 
 		 274 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2962  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.78 
 
 		 220 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00091403  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  25.19 
 
 		 223 aa  48.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  35.09 
 
 		 237 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  43.14 
 
 		 243 aa  45.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  34.38 
 
 		 226 aa  45.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  34.33 
 
 		 228 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  32.11 
 
 		 227 aa  45.1  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  34.33 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3945  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 244 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  35.21 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  28 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  30.43 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  29.35 
 
 		 225 aa  42.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  28.43 
 
 		 225 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3617  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 		 244 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3116  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.08 
 
 		 220 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431062  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  32.84 
 
 		 228 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  34.78 
 
 		 226 aa  40.8  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.13 
 
 		 223 aa  40.8  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 224 aa  40.8  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3315  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 236 aa  40.8  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>