255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2596 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2596  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
236 aa  484  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477747  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  29.57 
 
 
281 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4313  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.24 
 
 
261 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.678939  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  27.73 
 
 
292 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  25.85 
 
 
281 aa  91.7  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0944  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.16 
 
 
277 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  27.08 
 
 
225 aa  87  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 
332 aa  86.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4450  hypothetical protein  25.97 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  24.46 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  25.86 
 
 
365 aa  82  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  27.4 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  25.11 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.43 
 
 
277 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  26.25 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  26.82 
 
 
351 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  26.25 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  26.36 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  25 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  29.58 
 
 
372 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  29.58 
 
 
372 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  29.86 
 
 
372 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1808  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  27.27 
 
 
302 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.72827  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  22.51 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  24.9 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09183  putative metal-dependent hydrolase  26.69 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  25.73 
 
 
409 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  23.77 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  23.39 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  30.3 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  25 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  27 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  25.76 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.11 
 
 
393 aa  68.6  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  28.72 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.34 
 
 
386 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.74 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  24.15 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  28.19 
 
 
375 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  26.14 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  25.33 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  25 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  25 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  26.23 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.66 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  25 
 
 
374 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  25.77 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  25.77 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  25.45 
 
 
358 aa  65.5  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  22.09 
 
 
392 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  24.46 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  25.91 
 
 
358 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1816  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  24.46 
 
 
372 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.89 
 
 
385 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  25.48 
 
 
320 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  24.43 
 
 
336 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.34 
 
 
367 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  23.48 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2759  beta-lactamase domain protein  23.89 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0721774  normal  0.565273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
363 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  27.13 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  24.61 
 
 
226 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0583  beta-lactamase domain protein  22.41 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  23.39 
 
 
227 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  23.48 
 
 
274 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  27.56 
 
 
369 aa  62  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  24.35 
 
 
320 aa  61.6  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  24.26 
 
 
320 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  24.89 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  23.85 
 
 
320 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  25.48 
 
 
320 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  23.04 
 
 
274 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1358  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  31.21 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.07 
 
 
335 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  26.91 
 
 
220 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2750  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 
237 aa  58.9  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.435711  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33300  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  24.15 
 
 
315 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  24.2 
 
 
367 aa  59.3  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  24.89 
 
 
296 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  20.9 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  26.03 
 
 
228 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  23.68 
 
 
377 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1287  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.27 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.66334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  22.98 
 
 
362 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  22.37 
 
 
358 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  26.79 
 
 
333 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  23.79 
 
 
361 aa  57  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.27 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  26.97 
 
 
396 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  25 
 
 
374 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  25 
 
 
374 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  26.12 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  25 
 
 
374 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>