89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33300  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  100 
 
 		 315 aa  633  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2991  beta-lactamase domain-containing protein  43.54 
 
 		 275 aa  225  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2990  beta-lactamase domain-containing protein  39.62 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.718381  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2990  hypothetical protein  28.21 
 
 		 312 aa  85.9  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3627  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  24.09 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2596  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477747  normal  0.239808 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0372  hypothetical protein  21.32 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2125  metal-dependent hydrolase  27.13 
 
 		 226 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192097  normal  0.207518 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  26.09 
 
 		 227 aa  52.8  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  32.33 
 
 		 562 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  29.63 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0341  beta-lactamase domain protein  26.84 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13610  hypothetical protein  23.44 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831469  normal  0.423606 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 650 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 562 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  23.51 
 
 		 273 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  35.96 
 
 		 547 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0119  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  26.88 
 
 		 355 aa  49.3  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  32.81 
 
 		 580 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3617  beta-lactamase domain-containing protein  23.73 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05891  hypothetical protein  32.58 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.791064 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  27.07 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  26.32 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0950  putative metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  31.82 
 
 		 616 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2750  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.435711  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2221  hypothetical protein  30.89 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10841  hypothetical protein  26.89 
 
 		 238 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3945  beta-lactamase domain-containing protein  24.7 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  25.83 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10861  hypothetical protein  26.89 
 
 		 246 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208613 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29160  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  30.68 
 
 		 561 aa  46.2  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.813951  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0396  hypothetical protein  26.89 
 
 		 246 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.565727  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 561 aa  46.2  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4333  beta-lactamase domain-containing protein  22.55 
 
 		 241 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0741  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 		 568 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.33 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 555 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 		 566 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  34.09 
 
 		 559 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  23.11 
 
 		 573 aa  45.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  24.02 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  24.54 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0288  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.26 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.440104  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  28.38 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1324  putative L-ascorbate-6-phosphate lactonase UlaG  21.61 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10470  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  40.38 
 
 		 564 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797206  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  28.38 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2759  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0721774  normal  0.565273 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0981  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  25.27 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1763  metal-dependent hydrolase  23.7 
 
 		 229 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4733  hypothetical protein  24.51 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.633267  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1797  metal-dependent hydrolase  23.7 
 
 		 229 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  28.38 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4819  hypothetical protein  24.51 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0330621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1150  hypothetical protein  27.27 
 
 		 675 aa  43.9  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.920604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3180  beta-lactamase domain-containing protein  34.69 
 
 		 452 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  21.81 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  29.01 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1480  beta-lactamase domain protein  32.73 
 
 		 561 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0694172  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  28.81 
 
 		 565 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1789  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 		 561 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114581  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3581  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.764764  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11731  hypothetical protein  30.89 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1362  metal-dependent hydrolase  28.03 
 
 		 234 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 595 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 230 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 		 227 aa  43.1  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0306  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.13 
 
 		 635 aa  43.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 		 555 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 555 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 		 409 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.47 
 
 		 561 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3168  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 		 588 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0614  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2928  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 		 588 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2788  UPF0173 metal-dependent hydrolase  29.66 
 
 		 230 aa  42.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1270  metal-dependent hydrolase  31.93 
 
 		 229 aa  42.7  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  32.95 
 
 		 561 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  22.56 
 
 		 220 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  27.81 
 
 		 292 aa  42.7  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  28.68 
 
 		 556 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2567  hypothetical protein  30.77 
 
 		 245 aa  42.7  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  20.99 
 
 		 399 aa  42.4  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  22.39 
 
 		 559 aa  42.4  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>