30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0396 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0396  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.565727  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10861  hypothetical protein  98.78 
 
 
246 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208613 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05891  hypothetical protein  47.33 
 
 
250 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.791064 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2567  hypothetical protein  48.1 
 
 
245 aa  250  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2221  hypothetical protein  47.26 
 
 
245 aa  247  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10841  hypothetical protein  51.85 
 
 
238 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1009  hypothetical protein  49.1 
 
 
238 aa  242  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0580203  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11731  hypothetical protein  47.54 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.1092 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10881  hypothetical protein  48.65 
 
 
238 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10881  hypothetical protein  48.2 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0805  hypothetical protein  42.47 
 
 
248 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2296  hypothetical protein  43.36 
 
 
261 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.6365  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0013  hypothetical protein  40.49 
 
 
250 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3652  hypothetical protein  40.95 
 
 
255 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000420556  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4620  hypothetical protein  41.08 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411707  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2731  hypothetical protein  41.22 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3371  hypothetical protein  41.22 
 
 
259 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.515704  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1346  hypothetical protein  39.11 
 
 
260 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.33 
 
 
291 aa  52  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.56 
 
 
469 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  23.77 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2229  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0154515  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 
230 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33300  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  26.89 
 
 
315 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25 
 
 
590 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  25.52 
 
 
216 aa  45.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2268  metallo beta lactamase superfamily protein  24.03 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0942  beta-lactamase domain-containing protein  24.03 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0652855  normal  0.381593 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  32 
 
 
307 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  24.68 
 
 
296 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>