168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0574 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 230 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2268  metallo beta lactamase superfamily protein  75.22 
 
 		 230 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0942  beta-lactamase domain-containing protein  74.78 
 
 		 230 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0652855  normal  0.381593 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2229  beta-lactamase domain-containing protein  75.65 
 
 		 230 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2788  UPF0173 metal-dependent hydrolase  64.78 
 
 		 230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  61.3 
 
 		 230 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1519  metal-dependent hydrolase  46.85 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.835845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1769  metal-dependent hydrolase  45.92 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3663  metal-dependent hydrolase  49.31 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1715  metal-dependent hydrolase  45.65 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1362  metal-dependent hydrolase  45.92 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0942  metal-dependent hydrolase  44.98 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338724  normal  0.244099 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0561  metal-dependent hydrolase  46.02 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.844766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3315  beta-lactamase domain protein  42.98 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0596  metal-dependent hydrolase  45.58 
 
 		 237 aa  178  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  44.74 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0741  beta-lactamase domain protein  44.3 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  40.09 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  37.89 
 
 		 230 aa  154  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4333  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  36.4 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3617  beta-lactamase domain-containing protein  40.47 
 
 		 244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3945  beta-lactamase domain-containing protein  40.93 
 
 		 244 aa  144  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  39.81 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3467  beta-lactamase domain protein  41.4 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.407477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  37.66 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  36.36 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1763  metal-dependent hydrolase  35.4 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1797  metal-dependent hydrolase  35.4 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  36.36 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1270  metal-dependent hydrolase  35.37 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  37.39 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  38.67 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  38.46 
 
 		 274 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  37.98 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  37.61 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  37.98 
 
 		 227 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  37.98 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  37.98 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  37.98 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  39.34 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  35.06 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  37.02 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3294  metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.692615  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  36.49 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  37.33 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  34.21 
 
 		 228 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  37.84 
 
 		 266 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2368  beta-lactamase domain protein  34.91 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355207  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  36.68 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  39.62 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  37.2 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1154  hypothetical protein  34.65 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  35.34 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  34.51 
 
 		 226 aa  122  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  38.01 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  33.04 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  37.33 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  37.16 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1287  beta-lactamase superfamily hydrolase  33.78 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.66334  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  33.96 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  34.25 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  32.09 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  34.12 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5695  metal-dependent hydrolase  35.09 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0583  beta-lactamase domain protein  35.55 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2407  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000667891  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  34.76 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0962  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  35.11 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2759  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0721774  normal  0.565273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2127  metallo-beta-lactamase family protein  34.98 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2750  beta-lactamase domain protein  32.6 
 
 		 237 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.435711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2032  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.60548 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  31.74 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  31.14 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  30.4 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0878  hypothetical protein  34.07 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2724  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0491  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1347  beta-lactamase domain protein  33.61 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0129245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2125  metal-dependent hydrolase  27.52 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192097  normal  0.207518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1476  beta-lactamase domain protein  34.16 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  29.52 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>