139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4081 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  100 
 
 		 216 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  44.65 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  46.77 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  48.26 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  42.99 
 
 		 211 aa  174  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  42.73 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  42.73 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  42.73 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  42.47 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  40.45 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  43.83 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  45.65 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  41.46 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  39.57 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  41.87 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  40.89 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.27 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.16 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  36.84 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  37.37 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  38.79 
 
 		 214 aa  108  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  38.16 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  30.62 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.17 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1362  metal-dependent hydrolase  32.68 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  30.54 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  32.21 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  32.21 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  32.21 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  32.21 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  32.21 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  32.21 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  30.41 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  31.54 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  28 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  30.87 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3315  beta-lactamase domain protein  31.61 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  32.56 
 
 		 360 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  30.43 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  30.87 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  26.6 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  32.21 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 243 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.5 
 
 		 386 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2096  beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 		 535 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.894663  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1769  metal-dependent hydrolase  32.03 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2368  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355207  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 330 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 		 535 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  29.89 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3294  metal-dependent hydrolase  28.19 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.692615  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0942  metal-dependent hydrolase  32.24 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338724  normal  0.244099 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 538 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  27.7 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  30.46 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 		 409 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  24.73 
 
 		 244 aa  48.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0561  metal-dependent hydrolase  31.58 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.844766  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3663  metal-dependent hydrolase  30.92 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  36.76 
 
 		 530 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1238  polyketide synthase  36.76 
 
 		 530 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  36.76 
 
 		 530 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  36.76 
 
 		 530 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.92 
 
 		 385 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  23.15 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10861  hypothetical protein  24 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1519  metal-dependent hydrolase  32.03 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.835845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5192  hypothetical protein  36.36 
 
 		 541 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  30.15 
 
 		 403 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03728  hypothetical protein  39.39 
 
 		 537 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.42275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  28.05 
 
 		 361 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  34.84 
 
 		 265 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  24.16 
 
 		 324 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  23.6 
 
 		 324 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0596  metal-dependent hydrolase  30.92 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0396  hypothetical protein  25.52 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.565727  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  42.67 
 
 		 636 aa  45.4  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  33.57 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  29.53 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05891  hypothetical protein  33.56 
 
 		 250 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.791064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  36.45 
 
 		 257 aa  45.1  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  24.68 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  24.68 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  24.68 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  29.13 
 
 		 365 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1476  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2686  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.55 
 
 		 767 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00549034  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1715  metal-dependent hydrolase  28.95 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  26.85 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>