176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0725 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  35.55 
 
 
252 aa  178  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  36 
 
 
244 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  35.41 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  32.81 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  30.35 
 
 
299 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  32.32 
 
 
259 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  34.62 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  32.45 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  32.57 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  32.82 
 
 
257 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  31.3 
 
 
258 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  31.52 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 
298 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  30.59 
 
 
250 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.01 
 
 
304 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 
255 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  28.16 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  25 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  25.86 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.44 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  25.1 
 
 
262 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  25.32 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  28.2 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.85 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.55 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  26.61 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  24.9 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  27.43 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  24.36 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  26.7 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  25.28 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  24.79 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.9 
 
 
590 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  23.66 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  26.11 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  28.8 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  30.35 
 
 
336 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  26.95 
 
 
340 aa  65.5  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  28.31 
 
 
366 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.49 
 
 
362 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  25 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  30.96 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  29.95 
 
 
324 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  29.95 
 
 
324 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  29.95 
 
 
324 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  29.18 
 
 
324 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 
353 aa  62  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  28.49 
 
 
233 aa  62  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 
338 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  23.97 
 
 
361 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  28.94 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  27.92 
 
 
423 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 
352 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  28.76 
 
 
324 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  26.12 
 
 
358 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  23.68 
 
 
335 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  25.41 
 
 
236 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  24.66 
 
 
266 aa  58.5  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  24.48 
 
 
358 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  26.46 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  29.39 
 
 
332 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  28.93 
 
 
332 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  25 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 
324 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  29.27 
 
 
334 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  28.76 
 
 
324 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  24.1 
 
 
351 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  25.48 
 
 
303 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3315  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  28.33 
 
 
324 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  23.55 
 
 
356 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  26.3 
 
 
336 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2268  metallo beta lactamase superfamily protein  23.43 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  27.14 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  22.03 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0942  beta-lactamase domain-containing protein  23.43 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0652855  normal  0.381593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  24.18 
 
 
369 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  26.54 
 
 
273 aa  52.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3467  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
243 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.407477  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  24.79 
 
 
358 aa  52  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  27.05 
 
 
353 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  26.09 
 
 
335 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  24.08 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  24.48 
 
 
377 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.49 
 
 
335 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  26.42 
 
 
331 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.6 
 
 
364 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  26.06 
 
 
351 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0942  metal-dependent hydrolase  26.74 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338724  normal  0.244099 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 
230 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  24.31 
 
 
320 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  24.63 
 
 
388 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  25.28 
 
 
344 aa  48.5  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>