147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0743 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  58.1 
 
 		 258 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  64.71 
 
 		 262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  57.77 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  64.03 
 
 		 262 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  64.82 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  49 
 
 		 265 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  48.5 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.25 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  47.13 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  45.31 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  41.46 
 
 		 266 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.53 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  39.15 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  31.85 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  30.86 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  29.73 
 
 		 282 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  32.46 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  26.16 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  31.35 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876476 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  27.45 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  29.15 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  28.07 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  26.67 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  23.61 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  30.26 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  21.96 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  26.48 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  24.72 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  30.91 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  22.88 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  27.7 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  25.32 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  25.82 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  26.16 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  30.87 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  24.79 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  30.15 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  34.81 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.62 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  26.7 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  25 
 
 		 423 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  24.37 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  26.09 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  28.44 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  38.89 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  26.18 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  27.75 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  26.73 
 
 		 376 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  27.31 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  24.14 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.35 
 
 		 374 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  27.68 
 
 		 377 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  20.89 
 
 		 380 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.81 
 
 		 374 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  25.35 
 
 		 374 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  25.35 
 
 		 374 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  25.13 
 
 		 324 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.27 
 
 		 374 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  25.81 
 
 		 374 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  27.19 
 
 		 376 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  25.63 
 
 		 227 aa  52.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  24.06 
 
 		 324 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  28.45 
 
 		 372 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  25.13 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  25.13 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  25.13 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  26.64 
 
 		 281 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  24.47 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1021  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.96 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  29.68 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  25.53 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 		 409 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  43.84 
 
 		 372 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  23.4 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  26.73 
 
 		 374 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  34.88 
 
 		 336 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  26.67 
 
 		 372 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  28.9 
 
 		 332 aa  49.7  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  26.27 
 
 		 381 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.74 
 
 		 368 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  23.85 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  25.57 
 
 		 351 aa  49.3  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.5 
 
 		 362 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  28.98 
 
 		 396 aa  49.3  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  24.55 
 
 		 358 aa  48.9  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  28.5 
 
 		 332 aa  48.9  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  26.25 
 
 		 372 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  26.25 
 
 		 372 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  25.55 
 
 		 308 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  23.3 
 
 		 414 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  26.59 
 
 		 367 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>