57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0526 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 298 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  58.36 
 
 		 304 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  61.33 
 
 		 299 aa  342  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  51.51 
 
 		 293 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  56.69 
 
 		 255 aa  305  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  48.16 
 
 		 309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  54.34 
 
 		 299 aa  302  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  52.34 
 
 		 257 aa  278  7e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  46.15 
 
 		 258 aa  256  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  47.47 
 
 		 258 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  45.98 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  38.61 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  38.61 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  40.93 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  37.93 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  39.92 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  39.53 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  26.95 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  26.17 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  24.8 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  24.59 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.25 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  26.48 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  27.24 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  26 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  25 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  26.87 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  28.92 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  27.81 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  25.51 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  25.62 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.2 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  27.43 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.74415 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  21.97 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.42 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  25.23 
 
 		 366 aa  50.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2229  beta-lactamase domain-containing protein  25.49 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2268  metallo beta lactamase superfamily protein  24.9 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  23.86 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  32.65 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  23.24 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  24.23 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  28.28 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0942  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 		 230 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0652855  normal  0.381593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  25.81 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  21.99 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  22.97 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  27.08 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  19.69 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.82 
 
 		 335 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 		 236 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  28.41 
 
 		 226 aa  42.7  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  26.81 
 
 		 350 aa  42.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 352 aa  42.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>