77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1365 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  55.52 
 
 		 298 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  49.14 
 
 		 304 aa  299  4e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  48.62 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  49.14 
 
 		 293 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  52.76 
 
 		 255 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  52.29 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  51.18 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  46.9 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  48.26 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  45.1 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  43.97 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  43.97 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  40.23 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  40.38 
 
 		 244 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  36.82 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 		 255 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  38.91 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  27.35 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  23.4 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  27.57 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.04 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  27.47 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  26.32 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  25.49 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  25.25 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.02 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  26.17 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  23.48 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  24.41 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.19 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.22 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  24.37 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  28.57 
 
 		 366 aa  55.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  22.75 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  22.04 
 
 		 340 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  25.54 
 
 		 357 aa  53.1  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  21.62 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  23.24 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.36 
 
 		 386 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  25.37 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  23.27 
 
 		 363 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  24.35 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  22.61 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  25.1 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  20 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.14 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 		 372 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.33 
 
 		 354 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  21.31 
 
 		 351 aa  45.8  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.75 
 
 		 335 aa  45.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  22.49 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  28.04 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876476 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  21.51 
 
 		 357 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.5 
 
 		 590 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  22.5 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.02 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  23.19 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 		 218 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  22.14 
 
 		 367 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  21.46 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  21.46 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  22.73 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.66 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  24.81 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  23.94 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  27.66 
 
 		 242 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  23.53 
 
 		 336 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  22.51 
 
 		 365 aa  42.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  22.99 
 
 		 371 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  23.02 
 
 		 372 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  23.02 
 
 		 372 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  23.02 
 
 		 372 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>