93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1858 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  56.7 
 
 		 309 aa  351  7e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  51.51 
 
 		 298 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  49.31 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  54.47 
 
 		 257 aa  295  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  51.35 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  53.05 
 
 		 299 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  51.54 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  52.11 
 
 		 259 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  52.14 
 
 		 255 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  48.06 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  41 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  41 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  40.75 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  37.4 
 
 		 250 aa  175  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  41.96 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  39.85 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  32.45 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.52 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.38 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  24.91 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  24.05 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  27.72 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  25.56 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  26.94 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  26.57 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  27.04 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  27.94 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  24.72 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  23.49 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  23.47 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  22.88 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  24.62 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  25.38 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  23.05 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  25.1 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  22.84 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  24.62 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.3 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 		 225 aa  52.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  22.66 
 
 		 201 aa  52.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  26.12 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  24.8 
 
 		 338 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876476 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  24.8 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.87 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  21.99 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  30 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  30.7 
 
 		 352 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 		 236 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  24.28 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  24.77 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.9 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  27.05 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  24.8 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  23.08 
 
 		 230 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.4 
 
 		 354 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  22.22 
 
 		 258 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  22.89 
 
 		 362 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1270  metal-dependent hydrolase  24.89 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  23.19 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.09 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  24.5 
 
 		 369 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  23.29 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  23.27 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  26.13 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  24.64 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  24.17 
 
 		 226 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  25.56 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  23.75 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  23.02 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  25.58 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  26.01 
 
 		 227 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  26.01 
 
 		 227 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  26.01 
 
 		 227 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  20.75 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  26.01 
 
 		 227 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5695  metal-dependent hydrolase  22.87 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1763  metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1797  metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 353 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  22.9 
 
 		 224 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  25.68 
 
 		 357 aa  43.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.33 
 
 		 386 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25.95 
 
 		 368 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  24.88 
 
 		 230 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  24.81 
 
 		 320 aa  42.7  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  20.48 
 
 		 227 aa  42.7  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  25.09 
 
 		 225 aa  42.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  25.23 
 
 		 227 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1154  hypothetical protein  24.71 
 
 		 219 aa  42.4  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>