191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4915 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  100 
 
 		 272 aa  538  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  54.51 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  50.19 
 
 		 277 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  55.94 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  43.54 
 
 		 282 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  37.59 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  42.26 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  39.46 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  39.46 
 
 		 338 aa  190  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876476 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  37.58 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  39.29 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  37.29 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  34.16 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  31.68 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.2 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  32.46 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  30.83 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  31.42 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  31.03 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  30 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4450  hypothetical protein  29.52 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3291  beta-lactamase domain-containing protein  27.66 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.83 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  32.07 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  31.76 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.24 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  31.66 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  29.35 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  25.09 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  27.72 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  26.23 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.86 
 
 		 590 aa  68.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  34.72 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  34.3 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  33.16 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  26.64 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  24.81 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  27.86 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  26.14 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.97 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  22.83 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.71 
 
 		 386 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  35.48 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  28.69 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  28.69 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  27.12 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.08 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  24.77 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.59 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  27.08 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.14 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  28.78 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  23.13 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  27.5 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  27.5 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  29.49 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  24.4 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  29.03 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  26.34 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  25.94 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  35.14 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.57 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  30.6 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  26.67 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  27.67 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  28.63 
 
 		 380 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  30.56 
 
 		 423 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  27.78 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  23 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  25.26 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  26.91 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.57 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  24.69 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  26.77 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  27.73 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.2 
 
 		 385 aa  55.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04610  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 		 434 aa  54.7  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  25.6 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  28.95 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  28.91 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.57 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  28.91 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  28.91 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  28.91 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  28 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  28.95 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  28.95 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  29.08 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3652  hypothetical protein  26.74 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000420556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  20.95 
 
 		 392 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.13 
 
 		 419 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  29.63 
 
 		 324 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  26.67 
 
 		 358 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>