154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0942 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0942  metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338724  normal  0.244099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1769  metal-dependent hydrolase  75.55 
 
 		 234 aa  361  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1715  metal-dependent hydrolase  76.68 
 
 		 234 aa  358  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1519  metal-dependent hydrolase  72.65 
 
 		 234 aa  343  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.835845 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0596  metal-dependent hydrolase  73.15 
 
 		 237 aa  333  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0561  metal-dependent hydrolase  72.69 
 
 		 237 aa  331  6e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.844766  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3663  metal-dependent hydrolase  72.22 
 
 		 235 aa  330  9e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1362  metal-dependent hydrolase  60.43 
 
 		 234 aa  293  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0741  beta-lactamase domain protein  56.52 
 
 		 232 aa  270  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3315  beta-lactamase domain protein  54.04 
 
 		 236 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  55.74 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  46.47 
 
 		 243 aa  207  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0942  beta-lactamase domain-containing protein  44.98 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0652855  normal  0.381593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2788  UPF0173 metal-dependent hydrolase  44.98 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2268  metallo beta lactamase superfamily protein  44.54 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2229  beta-lactamase domain-containing protein  44.98 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  44.98 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  40.35 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  42.65 
 
 		 237 aa  174  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  41.36 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  40.91 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  40.91 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  40.91 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  40.91 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3294  metal-dependent hydrolase  42.59 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.692615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  40.45 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  40.91 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  40.45 
 
 		 227 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  41.51 
 
 		 242 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  38.01 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  41.63 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3945  beta-lactamase domain-containing protein  42.45 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  40.36 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  40 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  39.55 
 
 		 227 aa  158  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  40.36 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3467  beta-lactamase domain protein  43.06 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.407477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  44.39 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3617  beta-lactamase domain-containing protein  41.04 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  42.99 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1763  metal-dependent hydrolase  36.56 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1797  metal-dependent hydrolase  36.56 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  39.15 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  38.12 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  37.33 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  39.04 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1270  metal-dependent hydrolase  35.68 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  40.09 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  39.04 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  38.6 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  36.87 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  40.18 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4333  beta-lactamase domain-containing protein  38.91 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  37.96 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  38.97 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  34.65 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  38.99 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  35.59 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  36.74 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0583  beta-lactamase domain protein  39.73 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2368  beta-lactamase domain protein  34.58 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2407  beta-lactamase domain protein  35.65 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000667891  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5695  metal-dependent hydrolase  34.82 
 
 		 291 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2125  metal-dependent hydrolase  33.79 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192097  normal  0.207518 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2032  beta-lactamase domain protein  34.45 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.60548 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1287  beta-lactamase superfamily hydrolase  35.91 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.66334  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  33.76 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1154  hypothetical protein  36.79 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  35.85 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 		 224 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  36.41 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  30.43 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0962  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  32.46 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  33.96 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  33.49 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2759  beta-lactamase domain protein  36.94 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0721774  normal  0.565273 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  34.26 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2127  metallo-beta-lactamase family protein  33.18 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2724  beta-lactamase domain protein  34.02 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  35.87 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2750  beta-lactamase domain protein  34.96 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.435711  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0878  hypothetical protein  33.18 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1347  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0129245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0491  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1476  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  23.63 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>