172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0491 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0491  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
227 aa  466  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  56.89 
 
 
225 aa  263  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  55.51 
 
 
235 aa  242  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2032  beta-lactamase domain protein  48.44 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.60548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1476  beta-lactamase domain protein  44 
 
 
226 aa  198  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  43.11 
 
 
225 aa  191  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  41.05 
 
 
226 aa  169  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  41.41 
 
 
225 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  40.44 
 
 
222 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  40.17 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  37.83 
 
 
227 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  41.56 
 
 
223 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  37.17 
 
 
227 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  42.5 
 
 
225 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  36.96 
 
 
227 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  36.96 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  39.13 
 
 
226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  36.96 
 
 
227 aa  154  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  36.96 
 
 
227 aa  154  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  36.96 
 
 
227 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  36.96 
 
 
227 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1763  metal-dependent hydrolase  40.48 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1797  metal-dependent hydrolase  40.48 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3294  metal-dependent hydrolase  36.09 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.692615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  36.52 
 
 
227 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  36.52 
 
 
227 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2368  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 
227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  39.22 
 
 
226 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  36.52 
 
 
228 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2407  beta-lactamase domain protein  35.17 
 
 
233 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000667891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  38.33 
 
 
228 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  38.6 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  39.34 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  36.49 
 
 
226 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1270  metal-dependent hydrolase  37.62 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  37.74 
 
 
225 aa  138  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0583  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 
225 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  37.75 
 
 
229 aa  135  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  36.32 
 
 
225 aa  135  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  36.79 
 
 
225 aa  135  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  36.32 
 
 
237 aa  131  9e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  34.63 
 
 
230 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  37.8 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  36.14 
 
 
227 aa  126  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  33.91 
 
 
237 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  34.8 
 
 
227 aa  123  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1287  beta-lactamase superfamily hydrolase  35.98 
 
 
230 aa  123  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.66334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  37.31 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  34.39 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2125  metal-dependent hydrolase  32.17 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192097  normal  0.207518 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1154  hypothetical protein  36.76 
 
 
219 aa  116  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  35.22 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  34.35 
 
 
274 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  29.86 
 
 
233 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  33.91 
 
 
274 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 
230 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0741  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 
232 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3315  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  31.3 
 
 
227 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1347  beta-lactamase domain protein  34.5 
 
 
248 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0129245  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2788  UPF0173 metal-dependent hydrolase  34.6 
 
 
230 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1362  metal-dependent hydrolase  33.82 
 
 
234 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2750  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 
237 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.435711  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  28.96 
 
 
228 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2759  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 
239 aa  101  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0721774  normal  0.565273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0962  beta-lactamase domain protein  35.86 
 
 
230 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0878  hypothetical protein  32.76 
 
 
244 aa  98.6  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
222 aa  98.6  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0596  metal-dependent hydrolase  32.24 
 
 
237 aa  98.2  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2127  metallo-beta-lactamase family protein  28.22 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2724  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0561  metal-dependent hydrolase  31.78 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.844766  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2268  metallo beta lactamase superfamily protein  30.99 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0942  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0652855  normal  0.381593 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3663  metal-dependent hydrolase  32.71 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0942  metal-dependent hydrolase  30.73 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338724  normal  0.244099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1519  metal-dependent hydrolase  30.58 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.835845 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2229  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
230 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0154515  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  26.73 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3945  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24739  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3617  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
244 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5695  metal-dependent hydrolase  28.74 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1715  metal-dependent hydrolase  30.24 
 
 
234 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3467  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 
243 aa  85.5  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.407477  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1769  metal-dependent hydrolase  30.24 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 
285 aa  81.6  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  31.43 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  27.27 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  25.32 
 
 
362 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>