39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4643 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
217 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
217 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  98.62 
 
 
217 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  78.8 
 
 
218 aa  362  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  77.88 
 
 
216 aa  351  5e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  73.73 
 
 
212 aa  323  9e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  57.14 
 
 
219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  58.42 
 
 
215 aa  236  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  46.31 
 
 
211 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  42.73 
 
 
216 aa  168  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  49.74 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  46.08 
 
 
209 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 
209 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 
209 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 
209 aa  136  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  39.22 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 
210 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  37.44 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.89 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 
219 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 
211 aa  117  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.07 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  35.68 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  33.47 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  30.41 
 
 
218 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  34.3 
 
 
211 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  30.49 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  32.09 
 
 
190 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  28.31 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  30.11 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  30.3 
 
 
221 aa  48.5  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  28.14 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  26.67 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4313  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.27 
 
 
261 aa  45.1  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.678939  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  30.97 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1998  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  30.67 
 
 
357 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0119  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  31.82 
 
 
355 aa  42  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  20.98 
 
 
243 aa  41.6  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>