36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5131 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
218 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  89.4 
 
 
216 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  78.8 
 
 
217 aa  363  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  78.8 
 
 
217 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  78.8 
 
 
217 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  76.04 
 
 
212 aa  333  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  60.18 
 
 
219 aa  265  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  59.63 
 
 
215 aa  245  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  53.44 
 
 
207 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  43.95 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  40.45 
 
 
216 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  46.24 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 
209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  38.83 
 
 
209 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  36.62 
 
 
209 aa  136  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.43 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 
219 aa  124  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.53 
 
 
213 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  38.92 
 
 
212 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  37.39 
 
 
241 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.31 
 
 
219 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  37.75 
 
 
213 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  36.45 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  38.29 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  33.65 
 
 
211 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  30.09 
 
 
218 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  33.48 
 
 
214 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  29.95 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  29.22 
 
 
211 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  23.74 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  29.93 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  31.31 
 
 
395 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0119  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  30.14 
 
 
355 aa  42.4  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  23.73 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  25.93 
 
 
223 aa  41.6  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>