56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8107 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  100 
 
 
213 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  68.08 
 
 
210 aa  298  6e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  53.3 
 
 
212 aa  222  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  48.6 
 
 
214 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  51.89 
 
 
213 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  48.17 
 
 
218 aa  198  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  43.6 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  44.65 
 
 
209 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  44.71 
 
 
209 aa  175  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  43.32 
 
 
211 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  39.17 
 
 
211 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  39.25 
 
 
211 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  39.81 
 
 
219 aa  148  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  41.12 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.17 
 
 
219 aa  138  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  46.88 
 
 
190 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  36.7 
 
 
212 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  36.96 
 
 
209 aa  131  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  36.89 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  34.53 
 
 
218 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  39.27 
 
 
216 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  36.98 
 
 
216 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  36 
 
 
214 aa  118  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 
215 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  35.91 
 
 
207 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  29.86 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  25.67 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  33.6 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  26.67 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  25.77 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  27.78 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  24.87 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  28.88 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0741  beta-lactamase domain protein  33.9 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  25 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3315  beta-lactamase domain protein  37.35 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  48.94 
 
 
200 aa  45.8  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  27.57 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 
302 aa  45.4  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  25 
 
 
223 aa  45.1  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  25.12 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1362  metal-dependent hydrolase  29.51 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1769  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  28.8 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  28.57 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4450  hypothetical protein  27.22 
 
 
270 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  41.54 
 
 
230 aa  42.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0543  beta-lactamase domain protein  39.29 
 
 
263 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 
222 aa  42  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0489  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.9 
 
 
248 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 
230 aa  41.6  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>