44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0058 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  414  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  58.02 
 
 		 213 aa  231  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  53.3 
 
 		 213 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  51.64 
 
 		 214 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  49.06 
 
 		 210 aa  192  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  46.79 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  49.74 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  48.1 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  42.45 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  42.45 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  44.65 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  45.33 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  44.89 
 
 		 219 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  42.59 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  38.5 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  38.89 
 
 		 212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  37.84 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  37.26 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  37.44 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  38.92 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  45.07 
 
 		 190 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  36.22 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  36.84 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  39.5 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  37.38 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  34.43 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  30.52 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  25.57 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  28.71 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  25.73 
 
 		 255 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  25.4 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  27.17 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2368  beta-lactamase domain protein  31.33 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  31.54 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1114  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.97 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  31.4 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4450  hypothetical protein  30.22 
 
 		 270 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  33.33 
 
 		 258 aa  41.6  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2407  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000667891  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0721  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.78 
 
 		 269 aa  41.6  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>