33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1622 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  434  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  89.4 
 
 
218 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  78.8 
 
 
217 aa  356  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  77.88 
 
 
217 aa  351  5e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  77.88 
 
 
217 aa  351  5e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  79.17 
 
 
212 aa  339  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  58.64 
 
 
219 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  60.7 
 
 
215 aa  241  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  53.72 
 
 
207 aa  175  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  44.14 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  42.47 
 
 
216 aa  165  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  47.03 
 
 
209 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  39.15 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  38.21 
 
 
209 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  37.84 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.5 
 
 
214 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  35.9 
 
 
241 aa  122  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  38.42 
 
 
213 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.54 
 
 
219 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  39.64 
 
 
215 aa  121  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.98 
 
 
213 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  38 
 
 
210 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  33.04 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  32.3 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
211 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  32.47 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  33.55 
 
 
190 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  29.82 
 
 
211 aa  48.5  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  29.86 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0119  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  30.14 
 
 
355 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  28.57 
 
 
281 aa  41.6  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>