58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0779 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
209 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  88.04 
 
 
209 aa  367  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  44.7 
 
 
218 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.6 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  45.02 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.58 
 
 
214 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  43.87 
 
 
209 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  42.45 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  45.74 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  49.69 
 
 
190 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  42.45 
 
 
219 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  43.39 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  41.9 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  38.89 
 
 
211 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  42.13 
 
 
211 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  38.21 
 
 
216 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  37.91 
 
 
217 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 
217 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  36.62 
 
 
218 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  37.98 
 
 
212 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  39.42 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  40.1 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 
219 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  42.25 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.27 
 
 
219 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  41.58 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  38.38 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  39.23 
 
 
241 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  28.72 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  29.25 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  26.15 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  25 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  28.99 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  28.4 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  27.81 
 
 
227 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  27.81 
 
 
227 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  27.81 
 
 
227 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  27.81 
 
 
227 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  27.81 
 
 
227 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  27.81 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  28.24 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  27.81 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  27.81 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  26.13 
 
 
253 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  25.9 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3294  metal-dependent hydrolase  26.63 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.692615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.49 
 
 
258 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  27.65 
 
 
361 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
267 aa  42.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  27.75 
 
 
244 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 
263 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 
538 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  24.48 
 
 
214 aa  41.6  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  33.15 
 
 
211 aa  41.6  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  24.73 
 
 
362 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2177  hypothetical protein  29.17 
 
 
303 aa  41.2  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 
266 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>