174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0907 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
267 aa  535  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  54.26 
 
 
262 aa  279  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  44.44 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  41.39 
 
 
272 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  41.33 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  41.24 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  40.66 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  42.16 
 
 
255 aa  194  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  42.18 
 
 
268 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  40.59 
 
 
265 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  40.29 
 
 
267 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  43.33 
 
 
265 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  40.96 
 
 
254 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  40.07 
 
 
267 aa  192  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  43.8 
 
 
268 aa  191  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  40.29 
 
 
270 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  40.98 
 
 
265 aa  188  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  39.93 
 
 
272 aa  188  8e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  39.93 
 
 
272 aa  188  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  40.3 
 
 
272 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  41.7 
 
 
266 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  41.11 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  41.11 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  40.45 
 
 
266 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  36.63 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  40.29 
 
 
265 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  38.6 
 
 
267 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  40.82 
 
 
254 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  39.21 
 
 
284 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  41.64 
 
 
268 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  39.34 
 
 
269 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  39.21 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  40.23 
 
 
252 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  40.23 
 
 
252 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  38.85 
 
 
272 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  38.04 
 
 
272 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  41 
 
 
255 aa  169  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 
253 aa  168  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  38.85 
 
 
274 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  39.85 
 
 
267 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  37.86 
 
 
274 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  35.77 
 
 
252 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  35.4 
 
 
284 aa  159  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 
255 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  37.82 
 
 
269 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  35.25 
 
 
251 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  34.48 
 
 
264 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  36.88 
 
 
252 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  34.73 
 
 
255 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  37.73 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 
252 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  35.45 
 
 
260 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  36.02 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  36.15 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  32.56 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  31.82 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 
253 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  35.77 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  33.08 
 
 
286 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  30.3 
 
 
253 aa  129  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 
254 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 
253 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  31.75 
 
 
263 aa  124  2e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  34.73 
 
 
257 aa  122  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  29.34 
 
 
254 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  29.02 
 
 
492 aa  122  7e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 
253 aa  119  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  28.52 
 
 
264 aa  113  3e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 
259 aa  112  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
253 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  46.15 
 
 
100 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  26.97 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  30.63 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  24 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.04 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  26.12 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  25.42 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  25.73 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  27.84 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 
239 aa  62.4  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  25.45 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.78 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.74 
 
 
252 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.24 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  38.54 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  30.61 
 
 
150 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.56 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.87 
 
 
250 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2544  PhnP-like protein  31.72 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.797723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  30.24 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.77 
 
 
250 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 
274 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>