240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2582 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
239 aa  496  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  57.68 
 
 
242 aa  295  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  59.34 
 
 
239 aa  288  4e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  61.92 
 
 
240 aa  287  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  56.25 
 
 
240 aa  278  7e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  49.4 
 
 
246 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  48 
 
 
245 aa  222  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  48 
 
 
248 aa  209  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  35.66 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2213  beta-lactamase domain protein  37.35 
 
 
292 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.104031  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0734  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1298  PhnP-like protein  33.98 
 
 
274 aa  107  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  30.83 
 
 
251 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  34.45 
 
 
253 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 
261 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  30.54 
 
 
264 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  30.64 
 
 
253 aa  102  6e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  31.38 
 
 
253 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  31.25 
 
 
253 aa  101  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  29.54 
 
 
252 aa  101  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  29.8 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  28.81 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
251 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  29.96 
 
 
492 aa  95.1  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2544  PhnP-like protein  34.5 
 
 
275 aa  95.1  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.797723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  29.01 
 
 
286 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  29.24 
 
 
254 aa  93.6  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
254 aa  92  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 
252 aa  92  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  32.22 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  33 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 
252 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  31.71 
 
 
252 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  28.87 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 
251 aa  89  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  32.13 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  28.98 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 
255 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  23.58 
 
 
252 aa  85.1  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  30.91 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 
254 aa  79  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  25.1 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  40.23 
 
 
264 aa  75.1  0.0000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  33.05 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  30.22 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  40.23 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 
269 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  39.08 
 
 
100 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.06 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  28.88 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5991  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  30.67 
 
 
299 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823433  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.64 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.09 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1148  coenzyme PQQ biosynthesis protein B  28.64 
 
 
299 aa  68.6  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  26.32 
 
 
267 aa  68.6  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  27.05 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  26.96 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6165  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  28.12 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494701  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.15 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.15 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0518  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  29.6 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423522  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5898  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  28.12 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.323021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.94 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2158  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  31.03 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.790294  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.75 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  27.78 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  26.45 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.44 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 
267 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5968  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  27.23 
 
 
307 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824566  normal  0.0122877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  28.9 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  28.69 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1802  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  30 
 
 
299 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354155  normal  0.923595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  27.38 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  28.9 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3322  coenzyme PQQ biosynthesis protein B  30 
 
 
299 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.332476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 
267 aa  63.2  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3246  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  27.48 
 
 
307 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5122  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  27.48 
 
 
307 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1765  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.69 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  27.94 
 
 
272 aa  62.8  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  27.94 
 
 
272 aa  62.8  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  27.48 
 
 
307 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
262 aa  62.4  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.57 
 
 
257 aa  62  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.83 
 
 
254 aa  62  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  27.49 
 
 
272 aa  62  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>