126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4185 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 272 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  98.9 
 
 		 272 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  92.65 
 
 		 268 aa  494  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  77.12 
 
 		 269 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  73.43 
 
 		 267 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  75.28 
 
 		 269 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  59.85 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  56.98 
 
 		 265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  58.8 
 
 		 265 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  54.65 
 
 		 267 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  58.43 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  58.43 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  53.9 
 
 		 267 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  56.09 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  60.23 
 
 		 265 aa  298  7e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  55.22 
 
 		 265 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  55.22 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  55.02 
 
 		 266 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  53.18 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  59.09 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  57.68 
 
 		 268 aa  285  8e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  53.53 
 
 		 270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  54.17 
 
 		 267 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  51.31 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  51.31 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  50.37 
 
 		 284 aa  258  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  50.75 
 
 		 272 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  54.37 
 
 		 266 aa  254  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  50.19 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  48.12 
 
 		 271 aa  252  6e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  51.87 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  48.51 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  48.13 
 
 		 274 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  49.62 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  46.64 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  44.07 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  43.12 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  40.36 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  41.24 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  40.84 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  36.88 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  39.02 
 
 		 251 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  37.73 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  40.96 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  37.08 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  38.75 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  36.63 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  38.26 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  39 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  39.02 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  37.26 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  35.4 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  38.11 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  39.33 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  38.2 
 
 		 251 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 		 253 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 		 254 aa  152  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  32.21 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  34.7 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  35.82 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  31.85 
 
 		 253 aa  141  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  31.09 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  33.81 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 253 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  30.22 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  32.49 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  33.09 
 
 		 492 aa  126  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  30.55 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  40.74 
 
 		 100 aa  92.4  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  35.74 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  27.02 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  28.51 
 
 		 240 aa  72  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.41 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.41 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  24.8 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  32.24 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  27.53 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  22.83 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.62 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.62 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.33 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.9 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  38.54 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.79 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.84 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  27.01 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  25.59 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  25.83 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.54 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  29.23 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>