162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0031 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 262 aa  527  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  54.26 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  46.67 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  41.73 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  41.04 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  41.48 
 
 		 265 aa  195  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  39.26 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  42.97 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  42.42 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  42.42 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  41.2 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  39.19 
 
 		 272 aa  185  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  37.78 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  42.42 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  39.63 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  36.8 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  38.72 
 
 		 266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  38.06 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  40.22 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  38.72 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  36.47 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  40.22 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  36.57 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 		 269 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  42.8 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  40.52 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  36.94 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  36.8 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  36.7 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  39.3 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  39.3 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  36.09 
 
 		 274 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  40.15 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  35.07 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  35.07 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  33.58 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  32.05 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  39.63 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  35.63 
 
 		 286 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  40.67 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  36.33 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  33.72 
 
 		 264 aa  158  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  38.11 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  36.29 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  34.63 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  35.04 
 
 		 284 aa  155  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  36.09 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  36.58 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  34.72 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  34.59 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  33.6 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 		 254 aa  145  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  34.35 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  34.75 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  31.64 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  30.08 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  34.75 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  28.31 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  29.2 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  29.92 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  29.73 
 
 		 492 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  33.09 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  33.33 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  28.29 
 
 		 239 aa  89  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 245 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  41.9 
 
 		 100 aa  85.9  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  27.24 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  31.82 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.15 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  32.44 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.23 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.07 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.07 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.43 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  26.53 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  31.07 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.55 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  24.18 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.63 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  32.63 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  32.63 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  26.91 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.2 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4333  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.78 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4646  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.36 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.06 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.61 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>