108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47617 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  100 
 
 
372 aa  775    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  28.74 
 
 
260 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  24.36 
 
 
480 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 
252 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  32.85 
 
 
272 aa  96.3  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  26.99 
 
 
253 aa  94  4e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
254 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  29.2 
 
 
272 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
272 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  28.73 
 
 
272 aa  89.7  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  28.73 
 
 
272 aa  89.7  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 
253 aa  89.7  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  27.27 
 
 
264 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  27.74 
 
 
253 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  24.24 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 
270 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 
251 aa  86.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 
253 aa  86.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  25.3 
 
 
254 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 
251 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  27.19 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 
252 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  28.21 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  25.15 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  28.71 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  25.52 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  25 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  27.6 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  22.39 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  25.71 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  25.38 
 
 
492 aa  73.2  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  25.99 
 
 
286 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 
267 aa  72.8  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 
257 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  24.01 
 
 
252 aa  72  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  28.06 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.76 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  24.46 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  22.73 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  24.1 
 
 
267 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  26.12 
 
 
267 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.76 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  27.76 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.53 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  27.76 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  28.1 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  24.5 
 
 
270 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  22.97 
 
 
254 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.83 
 
 
252 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 
265 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  23.88 
 
 
271 aa  64.3  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  23.61 
 
 
266 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4333  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.09 
 
 
252 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  25.08 
 
 
259 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  22.7 
 
 
254 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  21.84 
 
 
246 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4646  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.66 
 
 
252 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  25.78 
 
 
265 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  24.82 
 
 
262 aa  59.3  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  23.77 
 
 
249 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  23.02 
 
 
254 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.98 
 
 
260 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.98 
 
 
260 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  25.59 
 
 
272 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.36 
 
 
265 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  24.77 
 
 
284 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  24.47 
 
 
249 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 
269 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  23.86 
 
 
265 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  23.86 
 
 
265 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  25.98 
 
 
272 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  24.64 
 
 
269 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.6 
 
 
255 aa  56.6  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  22.96 
 
 
261 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.67 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.32 
 
 
251 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  24.52 
 
 
245 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 
266 aa  53.1  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  39.53 
 
 
100 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  23.4 
 
 
239 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.13 
 
 
252 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.26 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  23.83 
 
 
255 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  23.64 
 
 
263 aa  47  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  25.46 
 
 
248 aa  46.2  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  22.49 
 
 
255 aa  46.2  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>