109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1288 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 284 aa  584  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  66.91 
 
 		 274 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  67.65 
 
 		 274 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  67.91 
 
 		 272 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  62.96 
 
 		 272 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  60.92 
 
 		 272 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  58.33 
 
 		 272 aa  325  7e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  58.33 
 
 		 272 aa  325  7e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  52.45 
 
 		 271 aa  304  9.000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  53.41 
 
 		 265 aa  279  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  53.82 
 
 		 265 aa  279  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  49.62 
 
 		 265 aa  278  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  52.09 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  51.91 
 
 		 265 aa  271  9e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  49.81 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  50.76 
 
 		 267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  50.57 
 
 		 266 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  53.08 
 
 		 268 aa  261  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  48.48 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  49.43 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  49.43 
 
 		 265 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  49.43 
 
 		 265 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  47.92 
 
 		 265 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  47.92 
 
 		 265 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  48.67 
 
 		 270 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  50 
 
 		 272 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  48.66 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  49.81 
 
 		 272 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  49.25 
 
 		 267 aa  244  8e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  46.99 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  50.57 
 
 		 266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  44.44 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  47.91 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  43.01 
 
 		 284 aa  236  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  47.13 
 
 		 269 aa  228  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  40.46 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  42.26 
 
 		 254 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  40.68 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 		 252 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  38.61 
 
 		 252 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  38.4 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  36.74 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  39.08 
 
 		 255 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  38.78 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  37.12 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  35.85 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  38.55 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  33.59 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  36.64 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  38.49 
 
 		 267 aa  165  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  38.49 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  35.5 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  33.95 
 
 		 260 aa  159  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  31.92 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  34.35 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  34.35 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  32.82 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  32.72 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  31.58 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  34.09 
 
 		 492 aa  132  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  31.6 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  50 
 
 		 100 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  28.68 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  34.43 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  26.41 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  26.51 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  27.13 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  42.53 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  29.2 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  38.1 
 
 		 150 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.32 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  28.29 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  34.88 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.5 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.3 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.85 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.18 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.52 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.28 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.74 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>