244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2787 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
254 aa  526  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  58 
 
 
253 aa  333  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  58.89 
 
 
253 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  58.17 
 
 
254 aa  323  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  53.54 
 
 
254 aa  298  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  49.21 
 
 
253 aa  262  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  49.8 
 
 
254 aa  260  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  46.09 
 
 
270 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  46.64 
 
 
253 aa  242  5e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  42.23 
 
 
252 aa  224  9e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  38.19 
 
 
264 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  39.76 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  38.98 
 
 
253 aa  208  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  38.19 
 
 
255 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  39.29 
 
 
252 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  37.8 
 
 
251 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  40.08 
 
 
492 aa  206  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  37.55 
 
 
255 aa  206  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  40.55 
 
 
252 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  40.55 
 
 
252 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  37.01 
 
 
255 aa  203  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  38.58 
 
 
260 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  37.4 
 
 
252 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  34.25 
 
 
286 aa  194  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  35.83 
 
 
251 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 
261 aa  190  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  38.28 
 
 
253 aa  189  4e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  35.83 
 
 
251 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  38.19 
 
 
257 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  33.99 
 
 
253 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  33.71 
 
 
272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  34.59 
 
 
272 aa  158  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  34.73 
 
 
265 aa  154  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  33.83 
 
 
272 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  33.83 
 
 
272 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  32.06 
 
 
272 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
259 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
265 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  31.44 
 
 
265 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 
269 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 
262 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  31.44 
 
 
265 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 
274 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  32.32 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  31.42 
 
 
274 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 
271 aa  137  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  28.9 
 
 
267 aa  135  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  29.28 
 
 
265 aa  135  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  30.22 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  30.22 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  28.78 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  29.28 
 
 
265 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  32.57 
 
 
268 aa  132  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  29.85 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  27.92 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  30.37 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 
263 aa  128  9.000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  28.62 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  28.73 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  32.33 
 
 
266 aa  126  3e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  29.59 
 
 
268 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  28.3 
 
 
266 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  27.65 
 
 
267 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 
269 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  28.63 
 
 
266 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  26.79 
 
 
264 aa  122  6e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  28.3 
 
 
267 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 
267 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  29.55 
 
 
255 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  27.88 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  31.22 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 
245 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.2 
 
 
257 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  46 
 
 
100 aa  101  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  30.19 
 
 
248 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.46 
 
 
265 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.77 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.77 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  26.27 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.67 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 
240 aa  89.4  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.2 
 
 
258 aa  88.6  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  27.23 
 
 
240 aa  88.6  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.84 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.84 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  27.54 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.45 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
274 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.49 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  25.3 
 
 
372 aa  85.5  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  23.97 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.84 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>