127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2683 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  85.71 
 
 		 266 aa  470  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  83.52 
 
 		 267 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  75.76 
 
 		 265 aa  424  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  74.81 
 
 		 270 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  73.96 
 
 		 267 aa  414  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  71.7 
 
 		 267 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  57.03 
 
 		 265 aa  308  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  54.72 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  59.07 
 
 		 265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  55.73 
 
 		 265 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  55.64 
 
 		 269 aa  292  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  56.6 
 
 		 267 aa  291  9e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  55.13 
 
 		 265 aa  289  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  55.47 
 
 		 268 aa  289  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  54.2 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  54.2 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  52.03 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  55.81 
 
 		 269 aa  285  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  54.65 
 
 		 272 aa  285  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  54.28 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  51.71 
 
 		 272 aa  278  6e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  52.27 
 
 		 272 aa  271  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  50.19 
 
 		 271 aa  271  1e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  52.67 
 
 		 269 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  55.89 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  52.29 
 
 		 272 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  52.27 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  52.27 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  49.81 
 
 		 274 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  47.41 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  50.57 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  53.85 
 
 		 268 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  48.29 
 
 		 274 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  47.74 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  44.15 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  41.7 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  42.53 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  39.23 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  40.96 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  39.23 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  39.53 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  35.52 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  38.72 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  39.31 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  37.16 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  35.74 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  38.55 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  38.55 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  37.12 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  34.81 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  35.45 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  35.34 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  34.87 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  35.91 
 
 		 492 aa  142  8e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  30.5 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  31.42 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  28.63 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  29.24 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  31.05 
 
 		 264 aa  115  5e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  46.53 
 
 		 100 aa  92  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  35.53 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  25.52 
 
 		 372 aa  75.5  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  27.55 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  27.84 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  29.48 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  26.75 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  38.38 
 
 		 480 aa  62.4  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.34 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.34 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  29.47 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.82 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  26.18 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.71 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.71 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.09 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.37 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.69 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  28.57 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>