152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2147 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  544  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  65.15 
 
 		 265 aa  359  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  64.02 
 
 		 265 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  64.02 
 
 		 265 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  63.74 
 
 		 265 aa  347  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  61.45 
 
 		 265 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  60.38 
 
 		 268 aa  308  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  55.43 
 
 		 272 aa  285  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  55.89 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  52.63 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  54.31 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  54.31 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  54.17 
 
 		 269 aa  275  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  51.33 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  52.09 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  52.47 
 
 		 266 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  54.05 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  50 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  54.2 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  54.37 
 
 		 272 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  54.37 
 
 		 272 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  48.9 
 
 		 272 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  49.81 
 
 		 272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  50.76 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  48.87 
 
 		 274 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  50.57 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  48.31 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  51.52 
 
 		 269 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  50.38 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  47.57 
 
 		 268 aa  250  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  49.43 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  47.37 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  44.69 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  48.08 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  43.98 
 
 		 271 aa  218  8.999999999999998e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  42.42 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  44.44 
 
 		 267 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  39.77 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  40.15 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  40.15 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  34.63 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  40.67 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  35.42 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  35.23 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  36.98 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  36.74 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  35.77 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 		 251 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  34.09 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  32.71 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  31.34 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  31.11 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  31.94 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  35.34 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  30.74 
 
 		 263 aa  131  9e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  31 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  30.77 
 
 		 492 aa  125  8.000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 		 259 aa  98.6  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  45.63 
 
 		 100 aa  97.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.01 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.01 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  31.43 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  30.67 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  26.79 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  26.83 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  31.45 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.24 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  26.16 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  27.45 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.8 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.44 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.44 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  27.24 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  25.26 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.47 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.54 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.91 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  37.27 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>