120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1460 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  553  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  87.27 
 
 		 267 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  76.89 
 
 		 265 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  74.72 
 
 		 270 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  73.48 
 
 		 266 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  71.7 
 
 		 266 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  71.7 
 
 		 267 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  54.72 
 
 		 265 aa  321  7e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  57.95 
 
 		 265 aa  315  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  55.94 
 
 		 265 aa  309  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  55.85 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  54.65 
 
 		 272 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  57.58 
 
 		 267 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  54.72 
 
 		 268 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  54.28 
 
 		 272 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  54.55 
 
 		 265 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  54.26 
 
 		 265 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  56.02 
 
 		 269 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  52.67 
 
 		 265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  52.67 
 
 		 265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  50.76 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  54.62 
 
 		 268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  49.81 
 
 		 272 aa  271  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  49.81 
 
 		 272 aa  271  7e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  49.81 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  48.47 
 
 		 271 aa  269  5e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  48.29 
 
 		 272 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  49.45 
 
 		 272 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  49.43 
 
 		 269 aa  265  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  49.62 
 
 		 272 aa  265  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  47.69 
 
 		 274 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  51.33 
 
 		 266 aa  261  8.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  49.62 
 
 		 268 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  46.62 
 
 		 284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  42.7 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  39.33 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  37.45 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  38.72 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  38.58 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  37.78 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  37.79 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  34.6 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  38.02 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  34.6 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  36.64 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  37.4 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  35.88 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  36.26 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  35.34 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  35.88 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  32.7 
 
 		 286 aa  158  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  35.09 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  33.21 
 
 		 260 aa  155  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  31.94 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  31.54 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  34.22 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 253 aa  139  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  31.44 
 
 		 492 aa  129  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 254 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  30.4 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  28.3 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  29.41 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  43.69 
 
 		 100 aa  90.1  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  27.57 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  32.04 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  25 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  40.2 
 
 		 480 aa  72.4  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  26.41 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  30.33 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  34.95 
 
 		 150 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.74 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.74 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  25.41 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.34 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.74 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.95 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.95 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  26.84 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.2 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.43 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.43 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.17 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>