125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0919 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 268 aa  543  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  73.18 
 
 		 265 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  70.61 
 
 		 265 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  68.2 
 
 		 265 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  65.52 
 
 		 265 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  65.52 
 
 		 265 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  60.38 
 
 		 266 aa  308  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  59.54 
 
 		 268 aa  298  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  57.89 
 
 		 272 aa  295  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  57.89 
 
 		 272 aa  295  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  56.06 
 
 		 272 aa  294  9e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  56.6 
 
 		 269 aa  292  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  57.14 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  54.62 
 
 		 267 aa  286  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  57.41 
 
 		 267 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  53.67 
 
 		 272 aa  281  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  53.67 
 
 		 272 aa  281  6.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  52.99 
 
 		 272 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  53.88 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  51.54 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  56.98 
 
 		 269 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  52.06 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  53.85 
 
 		 266 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  53.08 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  50.57 
 
 		 274 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  53.53 
 
 		 268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  51.34 
 
 		 265 aa  269  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  50.94 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  52.67 
 
 		 272 aa  265  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  51.54 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  51.54 
 
 		 266 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  48.53 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  49.61 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  52.33 
 
 		 269 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  50.57 
 
 		 267 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  47.21 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  43.68 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  42.69 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  43.02 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  43.02 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  42.37 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  43.43 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  41.76 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  39.92 
 
 		 255 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  42.8 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  39.08 
 
 		 270 aa  175  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  36.82 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  36.72 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  39.53 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  37.6 
 
 		 251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  36.6 
 
 		 261 aa  165  8e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  37.98 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  33.33 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 		 252 aa  156  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  37.07 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  33.98 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  34.6 
 
 		 492 aa  142  8e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  32.57 
 
 		 254 aa  142  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  34.75 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  34.44 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  32.09 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  32.71 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  45.54 
 
 		 100 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  28.57 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  35.14 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  28.68 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  29.67 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  28.98 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  28.99 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  30.16 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  29.26 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.47 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  32.51 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.15 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.04 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.41 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.77 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.77 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.97 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.62 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>