125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2707 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  100 
 
 		 270 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  77.74 
 
 		 267 aa  431  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  76.72 
 
 		 266 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  75.85 
 
 		 267 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  74.72 
 
 		 267 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  74.81 
 
 		 266 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  75.38 
 
 		 265 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  51.7 
 
 		 265 aa  298  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  55.3 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  56.44 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  53.76 
 
 		 269 aa  288  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  53.64 
 
 		 265 aa  288  8e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  53.96 
 
 		 268 aa  285  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  52.85 
 
 		 265 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  53.53 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  52.65 
 
 		 265 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  51.89 
 
 		 265 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  51.89 
 
 		 265 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  52.79 
 
 		 272 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  53.93 
 
 		 269 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  48.12 
 
 		 272 aa  261  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  48.67 
 
 		 271 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  47.23 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  47.74 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  47.69 
 
 		 274 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  48.67 
 
 		 284 aa  251  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  51.54 
 
 		 268 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  47.74 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  49.43 
 
 		 269 aa  248  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  48.09 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  46.01 
 
 		 272 aa  245  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  45.77 
 
 		 274 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  46.01 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  46.01 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  49.43 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  41.29 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  39.92 
 
 		 255 aa  191  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  38.93 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  38.93 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  38.93 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  40.75 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  37.59 
 
 		 254 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  38.93 
 
 		 251 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  36.8 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  37.69 
 
 		 255 aa  165  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  33.59 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  40.08 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  39.85 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  34.31 
 
 		 286 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  34.59 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  35.77 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  35.09 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  34.21 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  33.84 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  33.96 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  33.2 
 
 		 253 aa  145  8.000000000000001e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  33.09 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  32.71 
 
 		 492 aa  132  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  32.44 
 
 		 252 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  29.92 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  30.37 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 253 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  29.52 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  30.11 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  46.6 
 
 		 100 aa  97.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  28.03 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  29.41 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  26.34 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  32.04 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  27.71 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  29.48 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  24.5 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  35.92 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  37.76 
 
 		 480 aa  62  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.82 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.5 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.5 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.93 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.16 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.16 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  28 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.01 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.59 
 
 		 251 aa  48.9  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>