168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2878 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  75.98 
 
 		 256 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  75.98 
 
 		 256 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  74.02 
 
 		 249 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2259  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  74.8 
 
 		 250 aa  363  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  53.78 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  53.78 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.78 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.99 
 
 		 250 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.59 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.59 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.36 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.81 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.81 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.27 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.61 
 
 		 255 aa  234  8e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  48.62 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.06 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  51.91 
 
 		 258 aa  225  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.06 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  49.4 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.43 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.37 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.15 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4333  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.11 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4646  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.69 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.31 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  44.88 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.28 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  46.28 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  46.28 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.28 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  32.44 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  33.58 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  28.83 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 		 270 aa  89.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  32.1 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  32.1 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  27.99 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  25.99 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  29.14 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  30.71 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  26.81 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  27.84 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  27.01 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  30.55 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  31.32 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  24.9 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  29.51 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  27.02 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  28.47 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  24.52 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  30.82 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  29.59 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  30.82 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  29.68 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  31.27 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  28.93 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  26.84 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  30.55 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  30 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  30.55 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  29.18 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  23.42 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  26.02 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  28.72 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  28.47 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  24.25 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  27.96 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  28.93 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  28.68 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  31.36 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0793  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  31.36 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.824687  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  28.72 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  26.39 
 
 		 492 aa  53.5  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>