217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0467 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  100 
 
 
260 aa  528  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  100 
 
 
260 aa  528  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  68.13 
 
 
258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  62.4 
 
 
255 aa  322  5e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.57 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  55.38 
 
 
251 aa  306  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.22 
 
 
261 aa  294  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.22 
 
 
261 aa  294  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  58.98 
 
 
256 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  58.3 
 
 
249 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  57.81 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2259  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  60 
 
 
250 aa  271  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  53.78 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50 
 
 
250 aa  249  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50 
 
 
250 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.2 
 
 
260 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.6 
 
 
250 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.79 
 
 
257 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50 
 
 
265 aa  237  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  45.7 
 
 
255 aa  228  7e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  45.16 
 
 
255 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  48.41 
 
 
249 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.43 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.52 
 
 
252 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  47.52 
 
 
252 aa  215  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  47.52 
 
 
252 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  48.02 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.11 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.67 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4333  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  45.87 
 
 
252 aa  204  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4646  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  45.45 
 
 
252 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  45.11 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  35.91 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 
270 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  32.19 
 
 
239 aa  99.4  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 
270 aa  96.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
261 aa  95.1  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  26.84 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  26.77 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  27.72 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  31.27 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  30.34 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
255 aa  87  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 
254 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  29.2 
 
 
252 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  29.2 
 
 
252 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  28.52 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  26.16 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  25.54 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  25.82 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  30.22 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  24.81 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  30.71 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  31.25 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  29 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  28.2 
 
 
257 aa  75.1  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  28.87 
 
 
492 aa  73.9  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  30.22 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  31.52 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  31.52 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  29.64 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  31.41 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  31.05 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  31.64 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  33.21 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  26.87 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  26.14 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  27.78 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  28.45 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  28.47 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  26.95 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  28.27 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  28.32 
 
 
272 aa  63.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
269 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  28.32 
 
 
272 aa  63.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 
269 aa  62  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 
274 aa  62  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  27.34 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  38.04 
 
 
100 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  27.02 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  27.5 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>